暂没有权威机构对昆明肾病医院进行排名，但相对比较好的有昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院等医院，其中昆明医科大学第一附属医院是一所集医疗、教学、科研、干部保健于一体的大型综合医院，是昆明医科大学的临床学院，医院在看肾病方面有不少专家及丰富的临床经验。 昆明医科大学第二附属医院肾脏内科是国家肾脏病临床医学研究中心的分中心、国家县级医院血液净化培训中心、腹膜透析培训中心。开展多种血液净化治疗模式及透析通路维护，率先在省内开展分子吸附再循环治疗，血透通路手术参加全国大赛分别获得一、二、三等奖，腹膜透析患者380余例，是省内具影响力的腹膜透析中心。 解放军联勤保障部九二零医院肾脏内科能进行常规血液透析、血液滤过、血浆置换、血液灌流、连续性肾脏替代等血液净化治疗以及腹膜透析治疗及肾病方面的治疗。