在体检或其他情况下发现肝区闷胀不适或疼痛、恶心、呕吐、腹胀等症状，高度怀疑轻度脂肪肝时，应及时到消化内科就诊，若出现其他严重不适反应，也要到相应科室就诊。通过腹部超声检查、腹部CT、腹部MRI、肝活组织检查等检查可以进行诊断，但要注意轻度脂肪肝要与肝癌、病毒性肝炎等疾病相鉴别。
腹部超声检查
当肝脂肪沉积超过30％时，可检出脂肪肝，肝脂肪含量达50％以上时，超声诊断敏感性可达90％。弥漫性脂肪肝表现为肝脏近场回声弥漫性增强，强于肾脏回声，远场回声逐渐衰减，肝内管道结构显示不清。
腹部CT
弥漫性脂肪肝表现为肝的密度普遍降低，严重脂肪肝CT值可变为负值。增强后肝内血管显示非常清楚，其形态走向均无异常，CT诊断脂肪肝的特异性优于B超。
腹部MRI
主要用于鉴别超声与CT上难以区分的局灶性脂肪肝、弥漫性脂肪肝伴正常肝岛与肝脏肿瘤。MRI波谱分析、二维磁共振成像是目前无创性诊断研究的热点。
肝组织活检
经常规检查和诊断性治疗仍未能确诊的患者；存在脂肪性肝炎和进展期肝纤维化风险，但临床或影像学缺乏肝硬化证据者；鉴别局灶性脂肪性肝病与肝肿瘤、某些少见疾病如血色病、胆固醇酯贮积病和糖原贮积病；血清铁蛋白和铁饱和度持续增高者推荐进行肝活检，尤其是存在血色沉着病C282Y基因纯合子或杂合子突变的患者。有以上四种情况时，需进行肝活检。
分析病史
是诊断脂肪肝的方法之一，许多轻度脂肪肝患者无特异性症状。约半数患者无明显自觉症状，部分患者有易疲劳、食欲降低、腹胀、肝区不适或隐痛、恶心、嗳气等。患者可能有长期饮酒史或有糖尿病，肥胖、营养不良及中毒性肝损伤等病史。
实验室检测
是诊断脂肪肝的方法之一，患者可有血浆球蛋白变化，特别是α1、α2及β脂蛋白增高，血清GGT、ALT、AST轻度增高或正常。但这些均为非特异性的变化，因而实验室检查并不能确切反映脂肪肝及其病因。
B超检测
B超检查可见肝实质呈微细致密的强反射光点，深部组织回升减弱。当肝细胞内脂肪沉积达到肝组织的30%以上时，B超即可作出诊断，随着脂肪沉积越多，诊断率越高。超声对重度脂肪肝的诊断率达95%。
CT检测
CT扫描示肝脏密度比其他脏器如正常脾脏、血管低下，增强后肝内血管影显示得非常清楚，其形态和走向均无异常。CT对脂肪肝的诊断具有优越性，其准确性优于B超。正常情况下，肝脏与脾脏密度均匀，CT值接近，比值≥1。但当肝细胞内有脂肪浸润时，肝脏密度减低，比值变小，因此临床常用肝脾比值来确定是否有脂肪肝。
肝活检检测
是确诊脂肪肝的金标准。采用的肝穿刺活检细胞学检查是确诊脂肪肝的唯一方法。目前多在B超引导下进行肝穿刺，抽吸肝组织活检，远较过去的盲目肝穿刺法准确安全，尤其对于局灶性脂肪肝或弥慢性脂肪肝伴正常肝岛与B超下肝癌鉴别有困难时具有独特的优越性。通过对活检组织显微镜下观察可以明确脂肪肝病变程度、类型、有无合并脂肪性肝炎和肝纤维化。对治疗以及预后判断亦有重要价值。但由于它是一种创伤性检查，存在风险，临床应用还是要谨慎选择。
轻度脂肪肝要与以下疾病相鉴别：
肝癌
肝癌尤其是小细胞肝癌和甲胎蛋白阴性的肝癌，很难与局限性脂肪肝鉴别。通常情况下小细胞肝癌多呈衰减，常有包膜影和门静脉侵犯。转移性肝癌多为超声增强，常见多结节，无门脉系统侵犯，CT显示肝癌多呈边界较清楚的密度减低区，加注造影剂后扫描组织对比增强。选择性肝动脉造影能较好地显示肿瘤血管或血管瘤。肝动脉造影虽然在鉴别肝血管瘤和肝癌时存在困难，但对于排除肝脓肿、肝囊肿等仍有一定价值。B超引导下肝穿刺活检是确诊各种肝内占位性病变的有效方法。
病毒性肝炎
脂肪肝患者肝内脂肪变性呈弥漫性分布，常需与病毒性肝炎等鉴别。病毒性肝炎患者除具有乏力、纳差、发热、恶心、呕吐、黄疸、尿黄等表现外，流行病学、病原学检查有助于确诊。
其他原因导致的脂肪肝
还需除外药物、全胃肠外营养、炎症性肠病、甲状腺功能减退、库欣综合征、β脂蛋白缺乏血症以及一些与胰岛素抵抗有关的综合征导致脂肪肝的特殊情况。
