ERCP是非常安全的手术，但也有一定的并发症，最常见的是急性胰腺炎，发生率大概在5%-10%。因为做选择性胆管插管时，热损伤会对胰管有一定干扰。另外，术中胰管意外显影也会导致胰腺炎。预防措施主要如下：
1、术前使用消炎痛栓剂，可一定程度上降低胰腺炎的发生率；
2、术中轻柔操作，尽量避免胰管显影；
3、用导丝介入法减少对胰管的干扰，也可降低发生率。一旦进入胰管，必要时可以置入胰管支架；
4、胆道疾病治疗后置入鼻胆管，在一定程度上可预防术后胰腺炎的发生；
5、术后禁食和预防性应用生长抑素也是预防术后胰腺炎发生的一种措施。