发烧的主要原因是因为生活环境改变，体内的正常菌群发生紊乱，各机体部的正常菌群的种类、数量都会发生改变，与机体失去平衡，致病菌得不到治愈，就会出现肠道症状，从而表现为水土不服。这样的情况下可以给予行益生菌，同时可以加强对症治疗，保护肠道黏膜，可以用中药，比如肠炎宁、蒙脱石散、藿香正气胶囊等治疗。如果出现发烧，最好去医院检查，看有没有合并感染的情况，如果有合并感染的情况，需要用抗生素或者抗病毒的药物进行治疗。
如果患者出现水土不服，可以适当喝茶叶、酸奶，避免胃肠道功能紊乱引起的腹痛、腹泻。也可以尽量保持原有的生活习惯和作息，选择与原来口味相近的食物，多吃水果、蔬菜，饮食要清淡，少吃辛辣、油腻食物。