吃大豆异黄酮的最佳时间是饭后。大量数据表明，饭后食用大豆异黄酮产品比餐前食用效果更好，并能减少肠道不适症状的发生。
大豆异黄酮是在小肠中被吸收，饭后食用，小肠处于工作状态，所以大豆异黄酮更容易被人体吸收，达到更好的滋补作用。一般来说35岁左右的女性可以适当服用大豆异黄酮调理身体，尤其对于更年期女性，能够调解失眠、盗汗、烦躁等症状。且大豆异黄酮还可以补充调节体内维生素E的含量，起到美白嫩肤等效果。同时也可以改善骨质疏松，有利于身体健康。
大豆异黄酮是养生保健的好食品，但是要注意从正规厂家购买，而且要严格遵医嘱定时、定量服用，才可达到最佳的治疗保健作用。