39周新生儿发生呼吸窘迫综合征，是否会导致新生儿出现不良的结局，主要和导致新生儿呼吸窘迫综合征的原发病不同而不同。最常见的导致足月新生儿发生呼吸窘迫综合征的原因是胎粪吸入综合征，或者是新生儿重症感染，尤其是肺部重症感染，最容易导致足月新生儿发生呼吸窘迫综合征。
就呼吸窘迫综合征的原发病而言，常见的是胎粪吸入综合征，严重的胎粪吸入综合征不仅可以导致新生儿发生呼吸窘迫综合征，同时可能会发生肺气肿、气胸等相关并发症，出现严重的肺动脉高压、低氧血症等，有可能会导致新生儿发生顽固性的低氧血症，从而导致新生儿出现预后不良，甚至会发生严重的脑损伤、肺出血，从而威胁到新生儿的生命。如果是轻症感染导致新生儿发生呼吸窘迫综合征，在积极有力抗感染的基础上，呼吸窘迫综合征很快就会治愈，所以预后相对比较好。
就呼吸窘迫综合征的原发病而言，常见的是胎粪吸入综合征，严重的胎粪吸入综合征不仅可以导致新生儿发生呼吸窘迫综合征，同时可能会发生肺气肿、气胸等相关并发症，出现严重的肺动脉高压、低氧血症等，有可能会导致新生儿发生顽固性的低氧血症，从而导致新生儿出现预后不良，甚至会发生严重的脑损伤、肺出血，从而威胁到新生儿的生命。如果是轻症感染导致新生儿发生呼吸窘迫综合征，在积极有力抗感染的基础上，呼吸窘迫综合征很快就会治愈，所以预后相对比较好。