支原体感染的途径主要是通过呼吸道进行传播，健康人吸入患者咳嗽、打喷嚏时喷出的口鼻分泌物而引起感染，主要是肺炎支原体感染，引起的是支原体肺炎，又称原发性非典型肺炎支原体肺炎，全年均可发病。

支原体肺炎是学龄前儿童及青少年常见的一种肺炎，主要就是通过飞沫来进行传播。还有一种是生殖支原体感染，主要的传播途径是性接触传播。成年人一般都是通过性接触传播。新生儿则由母亲生殖道分娩时感染，成人男性的感染部位在尿道黏膜，女性感染的部位在宫颈，新生儿主要引起结膜炎和肺炎。