做甲状腺超声应该挂哪个科室主要是看患者是否有甲状腺的基础疾病，以及甲状腺基础疾病的类型，大体情况如下：

1、没有甲状腺疾病：只是为了体检判断甲状腺是否有弥漫性，或者是占位性病变，选择的科室比较多，比如可以挂普通内科、便民号、体检科或者是内分泌科，都可以开具甲状腺超声申请单。

2、有甲状腺的基础疾病：要根据疾病的类型选择挂号的科室，如果有甲状腺功能异常，比如甲状腺功能亢进或者甲状腺功能减退，需要挂内分泌科。内分泌科主要是针对甲状腺功能的问题进行相应治疗的科室，患者做完超声以及甲状腺功能检查，医生可以为其指导用药进行相应的治疗。如果甲状腺功能正常，但是甲状腺内有占位性病变，可以选择甲状腺外科进行挂号。