福建医科大学附属第二医院眼科是福建省建立较早,规模较大,实力较强的眼科之一,是视觉中国第一行动眼科医师的培训基地和眼科临床医学硕士点。科室里比较优秀的医生有胡建民、吴瑜瑜、高莹莹等。胡建民作为学科带头人,在近视、视网膜病等诊治领域主持多项国家级课题;吴瑜瑜在眼底病与微创玻璃体手术方面造诣深厚,屡获省级科技奖项;高莹莹专注于干眼等眼表疾病及眼整形,参与制定国家专家共识并获得多项专利。