生殖器疱疹建议就诊于皮肤性病科，云南治疗生殖器疱疹医院排名靠前的是昆明市第三人民医院性病艾滋病科、昆明医科大学第一附属医院皮肤性病科、昆明医科大学第二附属医院皮肤性病科等，昆明市第三人民医院性病艾滋病科是昆明市重点学科，在免疫缺陷相关感染诊疗上省内领先；昆明医科大学第一附属医院皮肤性病科为国家临床重点专科，在复旦大学全国医院专科声誉排行榜位于前20名；昆明医科大学第二附属医院皮肤性病科是国家人社部博士后科研工作站，在2020复旦大学医院专科排行榜西南提名第二。
1、昆明市第三人民医院 性病艾滋病科
该科室是昆明市重点学科，也是市级临床诊疗技术中心与慢病随访管理中心，斩获多项省市级科技奖励，获评全国优质护理服务表现突出病房。可开展机会性感染、免疫缺陷相关疾病的全程规范化管理，能够对生殖器疱疹合并免疫缺陷的患者进行综合诊疗，同时还可开展血液透析、人工肝、肿瘤化疗、血管介入等配套治疗，对各类免疫缺陷相关感染性疾病处置经验丰富。
2、昆明医科大学第一附属医院 皮肤性病科
该科室是国家临床重点专科，也是云南省唯一的公立皮肤病专科医院，在复旦大学全国医院专科声誉排行榜位于前20名，搭建起性病检验、皮肤影像、光动力等多个诊疗平台，设有独立性病亚专业组。配备皮肤镜、皮肤CT、光动力治疗系统等设备，依托完善的性病检测体系规范诊治生殖器疱疹，同步开展梅毒、尖锐湿疣、真菌性皮肤病、高原光损伤性皮肤病的诊疗，可开展Mohs手术、各类激光美容、光动力等前沿技术。
3、昆明医科大学第二附属医院 皮肤性病科
该科室为国家人社部博士后科研工作站、国家药物临床试验专业，是云南省自身免疫皮肤病研究中心，在2020复旦大学医院专科排行榜西南提名第二，红斑狼疮、大疱病、光敏性皮肤病诊疗水平国内知名。配备完善的皮肤专科诊疗设备，可借助专科检验手段明确生殖器疱疹病情，同时擅长银屑病、重型药疹、皮肤恶性肿瘤、皮肤溃疡等疾病的救治，开展皮肤外科、医学美容、创面修复等特色诊疗项目。
4、云南省第一人民医院 皮肤科
该科室是皮肤病与性病教学基地，长期承担临床教学与基层医师培养工作，深耕多种皮肤病的综合诊疗。配备激光、电子治疗仪、冷冻治疗等设备，完善真菌镜检、过敏原检测等检验项目，可对生殖器疱疹进行规范的检测与对症处理，还能开展白癜风表皮移植、腋臭手术、皮肤赘生物切除等治疗，对过敏性、真菌性、增生性皮肤病变均有成熟方案。
5、云南大学附属医院 皮肤科
该科室为国家级皮肤病与性病学住院医师规范化培训基地，兼顾中西医结合诊疗模式，在省内拥有较高知名度。配备点阵激光、二氧化碳激光、皮肤镜、窄谱UVB光疗仪等设备，可依托病毒相关检测手段评估生殖器疱疹，对带状疱疹、寻常疣、湿疹、红斑狼疮、痤疮等皮肤病开展综合诊治，常规开展光子嫩肤、瘢痕注射、皮肤外科手术等特色项目。
