云南中医科医院排名比较靠前的是云南省中医医院、昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院。云南省中医医院内科专注内分泌呼吸心血管等系统疾病，诊疗针对性强效果突出。昆明医科大学第一附属医院中医科为国家级重点专科，中西医结合诊疗水平省内领先。昆明医科大学第二附属医院中医科亚专科齐全，中医特色疗法丰富，临床与教学成果丰硕。
1.云南省中医医院 内科
云南省中医医院内科由高职称资深医师组成，具备扎实的临床功底与丰富诊疗经验，熟练处理内科各类常见病多发病及疑难病症，科室在糖尿病甲状腺功能异常等内分泌疾病大叶性肺炎间质性肺炎哮喘等呼吸系统疾病以及冠心病心肌缺血心肌炎等心血管疾病诊疗上形成显著优势，诊疗方案贴合患者病情，疗效稳定可靠，为患者提供专业规范的中医内科诊疗服务。
2.昆明医科大学第一附属医院 中医科
昆明医科大学第一附属医院中医科历史悠久名家底蕴深厚，拥有多名国家级省级名老中医学术继承人，是国家中医药管理局风湿类疾病重点建设专科及全国综合医院中医药示范单位。科室设多个特色专病门诊，开展中药封包针灸穴位贴敷等特色外治法，在类风湿关节炎痛风失眠肿瘤术后调理等病症诊疗上水平较高，同时承担国家自然科学基金项目与高校教学任务，积极开展国际中医交流，科研教学与临床协同发展。
3.昆明医科大学第二附属医院 中医科
昆明医科大学第二附属医院中医科设有中医内科针灸肛肠骨伤四大亚专科，为云南省胆囊切除术后综合征中西医协同防治基地。科室运用中药针灸及中西医结合手术治疗慢性疾病颈腰椎痛症肛肠及骨伤疾病，开展三伏贴平衡火罐等传统疗法，发表学术论文百余篇，承担国内外留学生教学与援外医疗任务，与德国长期开展针刺镇痛合作，多名医师获国际医疗表彰。
4.解放军联勤保障部九二零医院 中医科
解放军联勤保障部九二零医院中医科是全军中医内科专科中心与国家股骨头坏死重点专病中心，也是军区中西医结合诊疗中心。科室独创中西医结合六联疗法治疗股骨头坏死，荣获军队医疗成果二等奖，以中医及中西医结合手段治疗股骨头坏死颈腰椎病骨质疏松等骨关节疾病，同时开展内科疑难病与肛肠痔瘘疾病诊疗，中医康疗配套设施完善，诊疗技术与服务质量在军队及地方均有较高认可度。
5.云南省第一人民医院 中医科
云南省第一人民医院中医科历史悠久，拥有国家级名中医与云南省名中医领衔的专业团队。科室以中药汤剂为主，配合针灸拔罐推拿等疗法诊疗内妇儿常见病，重点发展妇科骨伤皮肤风湿骨痛等专病诊疗，在月经病不孕不育消化呼吸疾病治疗上独具特色。科室近十年发表论文百余篇出版专著十余部，四项科研获云南省科技进步三等奖，在省内中医领域影响力广泛。
