毕节三甲医院有毕节市第一人民医院、毕节市中医医院两家。毕节市第一人民医院是第四军医大学西京消化病医院毕节整合医学中心，现有1个省级重点学科。毕节市中医医院拥有国家级重点专科1个（肝病科），省级重点学科2个。
第一名：毕节市第一人民医院
毕节市第一人民医院为一所集医疗、教学、科研、急救、健康和公共卫生保障为一体的三级甲等综合医院，是第四军医大学西京消化病医院毕节整合医学中心。医院开设38个临床科室、9个医技科室，现有1个省级重点学科，2个省级重点扶持学科，1个市级重点实验室，23个市级重点学科（含扶持）。
第二名：毕节市中医医院
毕节市中医医院是一家集医疗、科研、教学、预防、保健、治未病于一体的三级甲等综合性中医医院。医院拥有国家级重点专科1个（肝病科），省级重点学科2个：针灸科、脾胃病科，省级重点专科6个：针灸科、脾胃病科、肝胆外科、骨伤科（已验收）、肾病科（已验收）、儿科（已验收），省级重点专科建设单位2个：脑病科、肛肠科。
第三名：威宁彝族回族苗族自治县人民医院
威宁彝族回族苗族自治县人民医院为一所集医疗、教学、预防、保健、健康体检、急救为一体的三级综合医院。设有29个临床科室，其中心内科、重症医学科、骨外科为重点专科。除常规技术外，现可开展腹部外科、妇科、肝胆外科等微创手术；骨外科可开展各种复杂关节内骨折手术，脑外科可开展脑肿瘤切除术、高血压脑出血血肿清除术等技术。
第四名：金沙县中医医院
金沙县中医医院是一所集医疗、急救、康复、预防、科研、教学等为一体的三级中医综合医院，是中南大学湘雅二医院联盟医院、贵州省首家县级产前筛查远程控制中心。医院的骨伤科属省、市级中医重点专科，有5个省级中医重点专科、2个市级中医重点专科正在建设，先进医疗设备齐全。