亳州医院排名靠前的有亳州市人民医院、亳州市中医院、蒙城县第一人民医院等。其中亳州市人民医院为全国百姓放心百佳示范医院，全科医学科、儿科等科室被评为十四五省级临床重点专科；亳州市中医院是安徽省中医区域医疗建设中心单位等，拥有多个重点专科，包括省级重点专科6个、市级重点专科9个等；蒙城县第一人民医院具有七十多年的历史，拥有胸痛中心、创伤中心、卒中中心等，医疗技术已达到本地区医院领先水平。
第一名：亳州市人民医院
亳州市人民医院是一所集医疗、教学、科研、康复、急救、健康维护、司法鉴定于一体的国家三级甲等综合性医院，为全国百姓放心百佳示范医院、国家级住院医师规范化培训基地。医院中一批学科带头人和中青年骨干在周边地区已具有一定的知名度和影响力，全科医学科、儿科、心血管内科、呼吸内科、骨科、重症医学科、普通外科、神经内科被评为十四五省级临床重点专科。
第二名：亳州市中医院
亳州市中医院是一所集中医医疗、教学、科研于一体的三级甲等中医医院，是培养中医药临床人才的摇篮，是安徽省“北华佗、南新安”重点建设单位，安徽省中医区域医疗建设中心单位等。目前拥有国家中医药管理局农村医疗机构中医特色优势重点专科1个，省级重点专科6个、市级重点专科9个。
第三名：蒙城县第一人民医院
蒙城县第一人民医院是皖北地区规模较大的三级综合医院，具有七十多年的历史。医院集医疗、科研、教学、急救、康复、保健等多功能于一体，医院拥有胸痛中心、创伤中心、卒中中心、急危重症孕产妇救治中心、急危重症新生儿救治中心、肿瘤多学科治疗中心、康复理疗科中心、呼吸与危重症治疗中心、血液透析治疗中心、眼科中心，医疗技术已达到本地区医院领先水平。
第四名：涡阳县中医院
涡阳县中医院始建于1958年，是一所集医疗、教研、预防、保健为一体的中医医院。医院现代化医疗仪器设备齐全，医疗水平大幅提升，医疗业务连续两年高速发展，2019年省卫健委批准分院设置三级中医医院。
第五名：利辛县人民医院
利辛县人民医院是一所集医疗、教学、科研、康复、急救为一体的三级综合性医院。其中，利辛县急救中心2014年被评为省级重点特色专科，康复中心2015年被评为市级重点专科，神经内科2016年被评为市级重点学科，新生儿科、ICU、感染科、心内科四个科室2017年被评为市级临床重点学科，医院医疗服务能力及综合急救能力进一步提高。