上海儿科比较好的医院为复旦大学附属儿科医院、上海交通大学医学院附属儿童医学中心、上海交通大学医学院附属新华医院等。复旦大学附属儿科医院是国家儿童医学中心、全国儿科学重点学科等，在小儿多疾病的诊治方面处于国内领先、国际先进水平，在全国儿科学界的领先地位已经确立，享誉海内外。上海交通大学医学院附属儿童医学中心拥有国内一流、与国际接轨的先进医疗设备，诊疗技术先进。上海交通大学医学院附属新华医院是国家重点建设学科和上海市重点学科。
第一名：复旦大学附属儿科医院-儿科综合内科
复旦大学附属儿科医院是国家卫生健康委预算管理单位，是集医、教、研、防、管为一体的综合性三级甲等儿童专科医院，是国家儿童医学中心、全国儿科学重点学科、国家“211”、“985”和“双一流”工程建设单位。医院儿内科是国家临床重点专科、上海市重中之重重点学科、儿科疾病临床医学中心、上海市遗传代谢病筛查诊治中心、上海市儿科临床质控中心等，在小儿的呼吸系统、消化系统等疾病的诊治方面处于国内领先、国际先进水平，在全国儿科学界的领先地位已经确立，享誉海内外。
第二名：上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心-儿内科
上海交通大学医学院附属儿童医学中心综合内科由综合病房、新生儿病房、NICU、PICU、门诊、观察室和急诊室组成。其中包括小儿急救、新生儿、呼吸、消化、感染、内分泌、肾脏、免疫、神经等9个专业。科室拥有国内一流、与国际接轨的先进医疗设备、技术手段和护理方法。在国内首创以全科医生为骨干，多专科医生共同会诊模式，各专科医生共同参与病人的诊治，以解决各有关专科及疑难病症。目前已开展多种检查项目。呼吸物理治疗是综合内科引进的国外先进技术，缩短了呼吸道感染的病程。
第三名：上海交通大学医学院附属新华医院-小儿内科
上海交通大学医学院附属新华医院儿内科学科门类齐全，医、教、研各方面成绩斐然，是国家重点建设学科和上海市重点学科。科室在国内率先建立了三级亚专业。专业技术应用经验丰富，年门急诊量70万以上。作为在全国最早建立ICU病房的儿科单位，配备了全套中央监护系统和进口新型呼吸机、床旁血气监测仪、24小时脑电监测仪和CRRT等重危病人抢救设施，重危病人抢救成功率在95%以上。
第四名：上海市儿童医院-儿内科
上海市儿童医院是一所集医疗、保健、教学、科研、康复于一体的三级甲等儿童医院，是我国第一家专科儿童医院。同时是上海医学遗传研究所、上海市儿童保健所、上海市儿童急救中心、上海市新生儿筛查中心、上海市儿童康复中心、上海市新生儿先心筛查诊治中心所在地。作为上海市文明单位，上海市儿童医院多次获得爱国卫生先进单位、无烟医院和绿色医院等诸多光荣称号。
第五名：上海交通大学医学院附属仁济医院-儿科
上海交通大学医学院附属仁济医院儿科医务人员临床经验丰富，涉及领域由原先单一的感染性疾病，先后扩展至儿童保健、血液、肾脏、心血管、消化、中西医结合、风湿免疫、变态反应疾病等不同亚专业。目前仁济儿科形成以儿童风湿和过敏为诊疗特色。
第六名：上海交通大学医学院附属第九人民医院-儿科
上海交通大学附属第九人民医院儿科是集医疗、教学和科研为一体的儿科综合性科室，在临床医疗、学科建设、科学研究及人才培养等方面取得了飞速发展和进步，积累了丰富的临床经验，拥有先进的医疗设备和雄厚的技术人才力量。
第七名：上海市第六人民医院-儿科
上海市第六人民医院儿科是为儿童提供全天候服务的三级甲等医院综合性科室，拥有完善的医疗服务质量和就医环境，为广大患儿的康复提供了强有力的保证，在儿科癫痫的诊断及治疗、儿科高热惊厥的防治、儿科心理行为的诊断及治疗等方面积累了丰富的经验。
第八名：上海长海医院-儿科
上海长海医院儿科属三级甲等综合性医院的专业科室集科研、临床和教学于一体，在儿科界已赢得了自己的一席之地，建立起了许多儿科疾病的诊疗特色，在医、教、研等方面取得了长足的进步，组成了一支技术过硬的专业团队，在全国具有较高的学术地位。
第九名：上海市第一人民医院-儿科
上海市第一人民医院儿科是医院特色重点学科，由著名儿科专家陈鸿达教授创建，是国内最早的儿科专业的临床、科研和培训基地之一，曾享誉海内外，有着悠久的历史与优良的文化传承。科室现有一支结构合理的医疗人才梯队，致力于过敏性疾病、矮小症、性早熟、肥胖等内分泌疾病的早期干预。