南京肺结核指定医院排名推荐靠前的是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院等，可就诊于感染病科。南京医科大学第一附属医院的感染病科为江苏省临床医学重点学科；南京鼓楼医院的感染性疾病科，是江苏地区综合性医院最早成立之一；东南大学附属中大医院的感染性疾病科在周边省市地区有较大的影响力。
第一名：南京医科大学第一附属医院-感染病科
南京医科大学第一附属医院的感染病科为江苏省临床医学重点学科，在SARS、H5N1禽流感、新型H1N1甲型流感、新型布尼亚病毒感染、肺结核等新发传染病的救治中，充分发挥了该科鉴别诊断和综合救治能力，出色完成所承担的危重病人的救治。对感染性休克、多脏器功能衰竭、中枢神经系统感染、以及特殊人群的重症感染、多重耐药菌感染等危重症的诊治能力，在江苏省及周边省市地区中也具有较高影响力。
第二名：南京鼓楼医院-感染性疾病科
南京鼓楼医院的感染性疾病科，是江苏地区综合性医院最早成立感染性疾病科的医院之一，目前已经成为江苏省“十二五”、“十三五”、“兴卫工程”、“强卫工程”、“医学创新团队”、江苏省临床重点专科、南京市医学重点专科，对于病毒性肝炎、脂肪性肝病、不明原因肝损、不明原因发热、疑难细菌及真菌感染、肺结核、新发传染病的诊治具有丰富的临床经验。
第三名：东南大学附属中大医院-感染性疾病科
东南大学附属中大医院的感染性疾病科，是集临床、教学和科研于一体的感染病专科，在肝脏疾病特别是慢乙肝干扰素的个体化治疗及多药耐药处置上积累了丰富的临床经验，同时擅长肺结核的诊治，在周边省市地区有较大的影响力。科室同时积极参与到省市、院内肝癌MDT、脂肪肝MDT团队，在专业团队的诊疗过程中发挥日益重要的作用。
第四名：南京市第一医院-感染性疾病科
南京市第一医院感染性疾病科，是南京市重点专科，设立感染病、肝病、腹泻病、发热、肺结核等专病门诊，全年诊治门诊患者超过两万人次。此外还承担院内外疑难病会诊、抗菌药物指导工作，每年会诊数超过1000人次。科室是南京医科大学感染病专业硕士授予点，有多项省市级课题在研。
第五名：南京市第二医院-结核病科
南京市第二医院结核病科是结核病省级临床重点专科，也是江苏省卫计委指定的省级定点医院。对江苏省内的同类医院和周边安徽省各市县的基层医院、综合医院的感染科、结核科形成了专业的引领和辐射；率先在全省常规开展结核菌培养和快速药物敏感实验以及结核菌分子检测技术。对肺结核合并大咯血病人行血管介入栓塞治疗，对肺结核合并糖尿病、HIV、肾病等免疫缺陷人群，重症结核病如肠结核、气胸、循环呼吸衰竭、休克等的治疗及重症维护，采取多学科协作诊疗的模式，取得良好的疗效，达到国内领先水平。
第六名：南京医科大学附属江宁医院-感染疾病科
南京医科大学附属江宁医院的感染疾病科，下设发热门诊、感染性疾病门诊、结核病门诊、肠道门诊、艾滋病专病门诊等，诊治范围包括各种病毒性肝炎及不明原因肝损害、肝衰竭、肝硬化、艾滋病、发热原因待查、肠道传染病及各系统结核病的诊断和鉴别诊断，参与指导全院抗生素合理使用。
第七名：中国医学科学院皮肤病医院-麻风与分枝杆菌实验室
中国医学科学院皮肤病医院麻风与分枝杆菌实验室，主要开展麻风及其他分枝杆菌感染的科研、预防监测、实验室诊断，以及教学等工作；制定麻风及其他分枝杆菌皮肤感染实验室诊断的标准化操作规程；开展麻风及分枝杆菌皮肤感染的耐药检测；开展肺结核的治疗等；承担国内外各项科研任务；定期对麻风病防治网络中的各省、市和县等科研人员、技术员进行培训；组织申报麻风等各类分枝杆菌感染相关的研究项目。
第八名：南京市胸科医院-结核科
南京市胸科医院结核科，为三个病区、两个研究室（结核病研究室和结核科纤支镜室）。为南京市卫生局重点发展科室。承担着江苏省及周边省市地区结核病的防治工作，结核病的报病和治愈率达到90%以上。结核菌的快速培养技术已达国内先进水平。市级以上研究、治疗中心：南京市结核病研究所。
第九名：南京市中西医结合医院-感染内科
南京市中西医结合医院的感染内科经过数年的努力发展，结合中医药特色优势，科室综合实力较前显著提高。是一支具有临床、带教、科研能力的中西医结合综合性队伍。科室人员具有长期从事感染性疾病诊治的丰富临床经验，擅长肺结核的诊断与治疗。拥有感染性疾病科门诊、发热门诊、腹泻门诊及独立的专科病房楼。
