厦门神经内科医院比较好的是厦门大学附属第一医院、厦门大学附属中山医院、厦门医学院附属第二医院等。厦门大学附属第一医院神经内科是闽西南地区最大、业务技术水平最强的神经内科，部分诊治已达国际一流、国内领先水平；厦门大学附属中山医院神经内科是厦门市最早独立建制的神经内科专科；厦门医学院附属第二医院神经内科开设多个特色专科门诊，业务范围涵盖了神经内科所有领域。
第一名：厦门大学附属第一医院-神经内科
厦门大学附属第一医院神经内科常年担负厦门、漳州、泉州及周边地区神经科常见疾病和疑难危重症的诊治任务，是闽西南地区最大、业务技术水平最强的神经内科，为西南地区神经系统疾病疑难重症的诊治中心，部分疑难、重症的诊治已达到国际一流，国内领先水平。科室开设有脑血管病介入、记忆门诊、神经免疫、头痛门诊、癫痫门诊、神经眼科、帕金森病门诊等专病门诊。
第二名：厦门大学附属中山医院-神经内科
厦门大学附属中山医院神经内科是厦门市最早独立建制的神经内科，门诊开设的癫痫专病门诊、神经症专病门诊、记忆障碍专病门诊、帕金森专病门诊、头痛专病门诊、中风二级预防专病门诊均为全市唯一。科室常年担负着厦门、漳州、泉州及周边地区神经内科常见疾病和疑难重症的诊治及会诊任务，是厦门最早开展脑血管病介入诊疗技术单位之一，现在仍为厦门市唯一可以独立开展全部脑血管病介入治疗的医院。
第三名：厦门医学院附属第二医院-神经内科
厦门医学院附属第二医院神经内科开设卒中、癫痫、帕金森病、痴呆、头痛、神经心理等特色专科门诊，业务范围涵盖了神经内科所有领域。擅长脑中风、脑供血不足、各类头痛、头晕、眩晕、耳鸣、记忆力下降、面神经麻痹、周围神经病变、脑膜炎、癫痈、痴呆、帕金森病、中枢神经系统自身免疫性疾病、变性疾病、共济失调等常见病的诊断及治疗，同时对疑难病的诊断有丰富的经验。
第四名：中国人民解放军第一七四医院-神经内科
中国人民解放军第一七四医院神经内科配备有64导及128导录像脑电图、床边电生理监测系统、PB760呼吸机、BEAR1000呼吸机、高压氧仓等大型医疗设备，在脑血管疾病、癫痫、脱髓鞘病、帕金森病和锥体外系等疾病诊疗形成特色。
第五名：厦门市第三医院-神经内科
厦门市第三医院神经内科是厦门市第三医院的重点学科，厦门市规划重点专科，全国脑血管防治办微创组协作科室，中国卒中中心联盟单位。开展的高血压性脑出血的微创颅内血肿清除术具有创伤小、效果好、费用低的优点，已开展了10余年，是厦门市最早开展此技术的科室，目前是全国脑防办微创组在厦门地区唯一一家协作单位。脑出血微创治疗于2012年列入厦门市规划重点专科扶持发展。
第六名：厦门大学附属翔安医院-神经内科
厦门大学附属翔安医院神经内科的诊疗范围包括急性缺血性脑血管病、神经肌肉病、神经系统变性病、神经系统感染及免疫性疾病等的诊断及治疗。科室重点发展脑血管疾病诊疗技术，建立脑卒中绿色通道及卒中单元。在脑血管疾病的诊治中有丰富的经验。
第七名：厦门市第五医院-神经内科
厦门市第五医院神经内科是集医疗、教学、科研为一体的神经内科治疗中心，是厦门东部地区规模最大的神经内科，拥有独立病区和专业的NICU的病房。科室以脑血管病预防治疗为专科特色，近几年开展的急性缺血性脑卒中早期阿替普酶（rt-PA）溶栓治疗，成效显著。科室在脑梗死、脑栓塞、脑出血、短暂性脑缺血发作等脑血管病急危重疾病诊治方面积累丰富的临床经验，同时对中枢神经系统感染、脊髓疾病、各型癫痫、肌病等疾病的诊疗也积累了丰富的临床经验。
第八名：厦门市海沧医院-神经内科
厦门市海沧医院神经内科担负着厦门市海沧区及漳州部分区域神经系统疾病的诊疗工作，尤其擅长脑血管病（如常见的脑梗死、脑出血）、中枢神经系统感染（如脑膜炎）、癫痫、偏头痛、帕金森病、神经肌肉病、脊髓疾病等专科病的诊治，科室独立开展脑电图、肌电图、TCD等辅助检查。
第九名：复旦大学附属中山医院厦门医院-神经内科
复旦大学附属中山医院厦门医院神经内科是国内首批成立的医学学科之一,目前是国家临床重点专科、国家教委重点学科，科内分设脑血管病、癫痫和发作性疾病、神经变性病(痴呆与帕金森病)和神经肌肉疾病等亚专科，为保障缺血性卒中患者及时救治，开通急救绿色通道，开展静脉溶栓、大动脉取栓工作。