哈尔滨肛肠科医院排名靠前的是黑龙江省医院肛肠科、哈尔滨医科大学附属第二医院结、直肠肛门病外科、哈尔滨医科大学附属第一医院肛肠外科等，黑龙江省医院肛肠科医师团队均为主治医师以上职称，能够处理痔疮、肛周脓肿、藏毛窦等多种肛周良恶性病变；哈尔滨医科大学附属第二医院结、直肠肛门病外科为普外科国家重点学科，年门诊量近7000人，是东北三省肠瘘治疗中心；哈尔滨医科大学附属第一医院肛肠外科可处理肛管癌、克罗恩病、溃疡性结肠炎等复杂肛肠疾病。
1、黑龙江省医院 肛肠科
该科室专注各类肛肠疾病的诊断与干预，诊疗范围覆盖痔疮、肛裂、肛周脓肿、肛瘘、肛乳头瘤、直肠息肉、直肠癌、骶前囊肿、骶尾部藏毛窦。科室针对高位复杂肛瘘采用特色引流挂线方案，减少反复紧线带来的痛苦，还可开展直肠癌NOSES微创术式，降低体表手术创伤。对于藏毛窦、骶前囊肿这类盆底深部病灶，会做好术前影像学评估，完整清除病灶，同时保护肛周正常组织，搭配创面局部理疗，加快术后创面愈合，减少术后感染、创面久不愈合等情况。
2、哈尔滨医科大学附属第二医院 结、直肠肛门病外科
该科室1999年成立，是普外科国家重点学科、东北三省肠瘘治疗中心，也是加速康复外科病房与临床营养支持中心，科室年门诊量近7000人，病房年收治患者近2000人，手术量近1200台。科室年收治肠瘘患者100余例，治愈率达95%以上，为全国三甲医院肠瘘收治例数第二位。科室2011年在东三省率先应用加速康复外科理念，省内最先开展微创PPH术，还可开展机器人结直肠切除、金陵术等手术，同时为肠外肠内营养全国培训基地，承担多项学术会议与医联体建设工作。
3、哈尔滨医科大学附属第一医院 肛肠外科
该科室深耕结直肠与盆底肛门疾病领域，除痔疮、肛裂、肛周脓肿、肛瘘、直肠脱垂等常见肛周病症外，对肛管癌、结直肠癌、溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠功能紊乱等复杂肠道疾病拥有成熟诊疗方案。科室擅长直肠癌超低位保肛手术，可借助腹腔镜完成NOSES等微创操作，尽可能保留肛门原有功能。面对克罗恩病合并肛周瘘管这类难治病例，会联合多学科制定长期管理方案，兼顾肠道基础病控制与肛周病灶的外科处理，维持肠道稳定状态。
4、哈尔滨医科大学附属第四医院 肛肠外科
该科室依托结直肠肿瘤微创诊疗平台开展工作，在肛周良性病变与结直肠肿瘤两方面同步发力，可处理痔疮、肛裂、肛乳头肥大、肛周脓肿、肛瘘、直肠脱垂，同时针对慢性便秘、肠易激综合征进行系统化管理。科室能够开展超低位保肛、NOSES无腹部切口等微创手术，在处理盆底功能异常引发的慢性便秘时，完善肛门直肠动力评估，区分出口梗阻与慢传输类型，把手术干预、菌群调节与盆底生物反馈训练结合，兼顾局部病灶切除与肠道功能重建。
5、哈尔滨市第一医院 肛肠科
该科室针对肛周良性疾病与肠道炎性病变形成稳定诊疗体系，可开展痔疮、肛瘘、肛周脓肿、肛裂的外科处置，也可处理慢性结肠炎、非特异性肠炎、直肠脱垂、肛乳头肥大。科室开设便秘专病诊疗路径，利用肛门直肠测压评估盆底功能，可开展PPH、STARR等微创术式处理重度痔与出口梗阻型便秘，同时推行肛肠日间手术，满足条件的患者可当日完成手术并离院，减少住院时长，同步做好术后随访，降低肛周病症复发概率。
