武汉大学中南医院擅长重症医学科、变态反应科、精神科、心血管外科、病理科。这5个科室均为集医疗、教学、科研为一体的综合性优势学科，拥有高超的诊疗水平。
1、重症医学科
是卫生部首批国家临床重点专科，诊疗水平位居全国第一梯队。科室承担了医院最危重患者的救治工作，尤其在救治严重休克、急性呼吸衰竭、急性肾衰竭、多器官功能障碍综合征、严重创伤、复杂感染、心跳骤停后综合征等方面有丰富的经验，抢救效果居于国内领先水平。
2、变态反应科
是湖北地区第二家独立成科的专门治疗过敏性疾病的临床科室。专科疾病谱覆盖呼吸道过敏、皮肤过敏、药物过敏、食物过敏以及严重过敏反应等多方面，医疗服务水平位于国内专科前列。
3、精神科
是我国综合医院中首家设立的神经学科与心理学科交叉、融合的临床专科。本学科是国家级核心高级认知障碍诊疗中心、心身医学诊疗中心；神经科医生与心理科医生组成多学科团队协作诊疗模式，重视对躯体与心理状态的全面评估与综合治疗，为全省医疗机构提供神经心理疑难疾病的会诊服务。
4、心血管外科
是武汉大学重点建设学科，现已成为立足湖北、辐射全国，集医疗、科研、教学为一体的大型心血管外科中心。拥有目前国际最先进的第四代“达芬奇”机器人手术系统和湖北省内最大的心血管外科杂交手术室，为心脏重症及移植患者生命护航。
5、病理科
在省内率先开展了免疫组化检测、荧光原位杂交、PCR、DNA测序等技术，使病理诊断精确到分子水平，更好的指导临床治疗，得到了业内高度认可。
