新疆肛肠外科医院排名比较靠前的医院是：新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院。
新疆维吾尔自治区人民医院肛肠外科为自治区级重点专科，结直肠肛门与盆底疾病诊疗水平全疆领先。新疆医科大学第一附属医院肛肠科以微创改良术式为特色，解决重度痔瘘裂等疑难病症成效突出。新疆医科大学第二附属医院普外科是自治区临床重点建设学科，肛肠专业并入大普外，微创胃肠与疝外科技术区域先进。
1、新疆维吾尔自治区人民医院 肛肠外科
新疆维吾尔自治区人民医院肛肠外科，科室全面开展结直肠肿瘤、盆底疾病、肛周复杂疑难疾病诊疗，常规开展达芬奇 / 腹腔镜 CME、TME、NOSES、ISR、Ta-TME、TEM 等微创根治术，拥有粪便无创基因早筛、3D 可视化、荧光成像等先进技术。在便秘规范化诊疗、肛瘘微创、藏毛窦皮瓣、骶前肿瘤切除等方面技术成熟，护理团队专科化程度高，快速康复与造口护理特色显著。
2、新疆医科大学第一附属医院 肛肠科
新疆医科大学第一附属医院肛肠科以微创手术为核心特色，擅长各类痔、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、直肠脱垂、肛门狭窄、藏毛窦、直肠阴道瘘等疾病治疗。科室创新开展多项改良术式。改良低切高挂治高位马蹄形肛瘘、改良外剥内扎治环状混合痔、改良内括约肌侧切治陈旧性肛裂，并发症少、恢复快、外形美观。率先开展小切口微创治顽固性肛门瘙痒，可开展 PPH、直肠前突修补、肛门失禁修复等疑难技术，曾获疑难杂症抢救治疗优秀奖。
3、新疆医科大学第二附属医院 普外科
新疆医科大学第二附属医院普外科为自治区临床重点建设学科、国家住培基地，下设肛肠等六个专业组。科室微创技术突出，腹腔镜胃肠肿瘤根治（胃癌、结肠癌、直肠癌 TME）、急腹症微创、各类腹壁疝腹腔镜修补术成熟。肝胆胰方面开展 LC 逾万台，成功率 99%，三镜联合治疗胆管结石、ERCP/EST 等内镜技术先进。年手术量近两千台，是疆内技术全面、综合实力雄厚的普外旗舰学科。
4、新疆医科大学第五附属医院 普外科
新疆医科大学第五附属医院普外科，诊疗范围覆盖肝胆胰、胃肠、甲状腺乳腺、血管及肛肠疾病。擅长胆囊结石、肝叶切除、胃癌根治、乳腺癌根治、甲状腺手术、消化道穿孔及肛肠手术，在胸腹联合伤、多发危重外伤抢救上经验丰富、救治成功率高。科室较早开展腹腔镜胆囊切除，安全微创、住院时间短、并发症极低，完成手术 2000 余例无严重并发症。
5、新疆阿克苏地区第一人民医院 肛肠科
新疆阿克苏地区第一人民医院肛肠科由主治医师以上职称骨干组成，临床经验丰富，擅长肛肠科常见病、多发病及疑难病规范化诊治。在痔疮、肛裂、肛瘘、直肠脱垂、肛乳头肥大、慢性便秘、肠易激综合征、慢性结肠炎、非特异性肠炎等疾病治疗上优势明显，能为区域内患者提供安全、有效、稳定的专科诊疗服务。
