南京肛肠外科医院排名比较权威的是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院。
南京医科大学第一附属医院结直肠、肛门外科在各类肛肠常见及疑难病症诊治上优势显著。南京鼓楼医院普通外科为国家临床重点专科，结直肠亚专科微创与盆底重建技术成熟。东南大学附属中大医院肛肠科以中西医结合为特色，微创及术后镇痛技术国内领先。
1.南京医科大学第一附属医院 结直肠、肛门外科
南京医科大学第一附属医院结直肠、肛门外科团队均为主治医师及以上职称，临床经验丰富，熟练掌握结直肠与肛门外科各类常见病、多发病及疑难病诊疗。在便秘、肛裂、肛瘘、肛门脓肿、混合痔等肛肠疾病治疗上具备显著专业优势，诊疗规范且疗效稳定，为南京及周边地区肛肠疾病患者提供专业诊疗服务。
2.南京鼓楼医院 普通外科
南京鼓楼医院普通外科是国家重点学科、首批国家临床重点专科，下设结直肠外科亚专科，具备强大的学科与科研实力，斩获多项省部级科技进步奖项。常规开展低位直肠癌根治、盆底重建、腹腔镜低位直肠癌原位人工肛门重建等特色手术，在结直肠肛门疾病微创治疗与复杂病例处置上经验丰富，同时承担多所高校博硕士研究生培养任务。
3.东南大学附属中大医院 肛肠科
东南大学附属中大医院肛肠科以中西医结合为核心特色，微创技术体系完善，常规开展PPH、RPH、多普勒引导下痔动脉结扎等先进术式。术后长效镇痛技术达国内领先水平，可显著减轻患者术后痛苦，在高位复杂性肛瘘、环状混合痔、直肠脱垂等疑难肛肠病症治疗上效果突出。学科团队均为硕博学历，兼具临床诊疗与科研教学能力。
4.南京市第一医院 普外科
南京市第一医院普外科是江苏省重点专科，为南京医科大学博硕士培养点，结直肠肛门外科亚专科以微创、无痛、快速康复为特色。常规开展结直肠肿瘤腹腔镜根治、低位直肠癌保肛及肛周疾病微创治疗，注重疾病早期筛查与干预。科室引进快速康复外科理念，有效缩短患者住院时间，在结直肠肛门慢性病规范化管理上表现突出。
