庆阳市人民医院擅长的科室有骨科、心血管内科、神经外科、胸心外科、肿瘤外科等。
1、骨科
庆阳市人民医院骨科是以关节外科、脊柱、微创外科为特色的科室。目前能完成骨科的各种手术治疗，包括复杂骨关节创伤的手术治疗、骨盆骨折手术治疗、骨质疏松症LISS钢板的手术治疗、小儿先髋及先天畸形矫治术，手部创伤及神经血管损伤的显微修复手术、断指（趾）再植及再造术。近年来在我市内开展了关节镜手术、脊柱疾患与外伤的治疗，腰椎滑脱的椎间融合手术治疗、脊柱侧弯的手术矫形治疗等。
2、心血管内科
庆阳市人民医院心血管内科，拥有西门子数字减影血管造影机、多台进口多参数心电监护仪，中央监护系统，电除颤仪，多导电生理仪及有创压力监测仪、24小时动态心电监测仪（12导）、24小时动态血压监测仪、食道调搏仪、微量泵、血气分析仪、快速血糖监测仪、心肌标记物快速监测仪等先进设备。科室形成了以心血管病介入诊断及治疗为主的临床医疗特色，包括起搏器植入术、射频消融术、冠脉造影+支架植入术、CRT-D植入术等。
3、神经外科
庆阳市人民医院神经外科，拥有先进设备，其中包括SIEMENS-Artis zee数字血管减影机1台，Haoke脑室镜1台等高精尖仪器设备。目前神经外科已开展各种颅内肿瘤摘除术，包括垂体瘤摘除术、听神经瘤摘除术、颅内转移瘤摘除术、面肌痉挛、三叉神经痛的微血管减压术、脊髓肿瘤包括高颈段肿瘤摘除术、椎管内肿瘤摘除等、颅内动脉瘤、脑血管畸形、颅内血管狭窄的手术及介入治疗、高血压脑出血等手术治疗。
4、胸心外科
庆阳市人民医院胸心外科，开展心脏房、室间隔缺损、动脉导管未闭及心脏瓣膜置换等手术治疗，得到广大患者的一致好评及同行的认可。科室拥有国内一流的专业设备：pm9000有创监护仪、微量注射泵、血气分析仪、肺功能测定仪及纤维支气管镜等。开展的胸外科诊疗业务主要有：食管癌、贲门癌的外科治疗和综合治疗。食管、贲门良性疾病（平滑肌瘤、憩室、贲门失迟缓症、食管裂孔疝、胃食管反流性疾病）的治疗。
5、肿瘤外科
庆阳市人民医院肿瘤外科，可开展肾癌、食道癌、肺癌、大肠癌、宫颈癌等常见恶性肿瘤的规范性根治手术及化疗。科室以外科手术治疗为主，结合化疗、内分泌、中医药及介入射频消融等多种治疗方法，对常见肿瘤进行标准根治手术及规范化治疗。开展主要诊疗有肺癌根治术、食管癌根治术、半肝切除术、胰头十二指肠切除术等。
