北京儿童比较好的医院是首都医科大学附属北京儿童医院、北京大学第一医院、首都儿科研究所附属儿童医院，首都医科大学附属北京儿童医院先在国内开展了新生儿溶血病的交换输血术，成功率高达100%。北京大学第一医院儿科是北京市重点学科，首都儿科研究所附属儿童医院对儿童罕见病有一定研究。
第一名：首都医科大学附属北京儿童医院
首都医科大学附属北京儿童医院内科率先在国内开展了新生儿溶血病的交换输血术，换血成功率100%，在治疗新生儿溶血症伴重度高胆红素血症方面取得良好效果。科室技术力量雄厚，并拥有高素质的护理队伍，常规开展深静脉置管、PICC置管、脐静脉置管、外周动静脉穿刺、新生儿抚触等技术。
第二名：北京大学第一医院-儿科
北京大学第一医院儿科是我国最早建立起来的现代儿科之一，是国家首批建立的博士点(1981年)和博士后流动站(1992年)、“211工程”重点学科的组成部分(2001年)，连续被评为国家重点学科(1989年， 2001年， 2007年)，是国家级继续教育基地(2003年)、卫生部专科医师培训基地(2005年)及儿科遗传性疾病分子诊断与研究北京市重点实验室(2014年)。
第三名：首都儿科研究所附属儿童医院
首都儿科研究所附属儿童医院是集儿科基础研究、临床、高等教育、预防保健为一体的三级甲等儿科医学机构。在六十余年的发展中，确立了以“儿童保健研究”“儿科疾病应用基础研究”“儿科感染性疾病的病原学研究”3个重点研究方向和有着明确科技创新特色的学科群，承担着国家、国际组织和国际间的多边合作以及科技部、国家卫健委等一系列关系到儿童保健、儿科常见病和罕见病等重大研究项目，课题具有前瞻性、科学性和指导性。
第四名：北京协和医院-儿科
北京协和医院儿科，孕育了中国儿科发展的奠基人和多位儿科大家，是中国现代儿科的发祥地，现逐渐发展成为提供全方位医疗服务的综合性儿科。发挥协和医院作为国家卫生计生委指定的全国疑难重症诊治指导中心的整体优势，协和儿科在早产儿、遗传病以及疑难疾病诊治等方面，在国内儿科系统享有盛誉。
第五名：中国人民解放军总医院-小儿内科
中国人民解放军总医院的小儿内科，分新生儿专科、儿童重病专科、儿童血液肿瘤专科、儿童保健专科、神经与康复专科、儿童常见病专科（呼吸、肾脏和消化）等特色专业。对儿童血液肿瘤的治疗达到国内领先水平，在国内率先采用多种免疫抑制剂联合治疗重型再生障碍性贫血，使存活率明显提高。目前已将造血干细胞移植治疗技术逐渐应用在除恶性血液病外的其他疾病，如自身免疫性疾病、先天性免疫缺陷病以及先天性代谢缺陷等疾病。
第六名：北京大学第三医院-儿科
北京大学第三医院的儿科包含新生儿重症监护病房、新生儿病房、普通儿科病房、儿科门急诊、儿童健康发展中心共5个部门；专业设置包括新生儿、重症医学、消化等11个专业，其中新生儿和儿童保健为学科重点专业。在危重新生儿救治、早产儿综合管理、身材矮小以及食物过敏诊治等领域位于国内同行前沿。
第七名：北京大学人民医院-儿科
北京大学人民医院的儿科2001年成为国家重点学科，尤其以血液、神经及新生儿专业为特色专业。儿科在国内率先完善了儿童白血病的MICM分型诊断，并率先开展了儿童白血病微小残留病的监测工作。近年来，还积累了大量CAR-T细胞治疗复发难治白血病的的临床经验，并探索这一全新的治疗技术在儿童白血病治疗领域的作用及地位，这项工作目前处于国内领先水平。
第八名：北京天坛医院-儿科
北京天坛医院的儿科是一个集医疗、教学、科研、预防和健康教育于一体的专业科室，在国内率先开展了痉挛型脑性瘫痪的肉毒毒素治疗，取得良好的治疗效果和社会效益，并在小儿癫痫、先天或遗传代谢性疾病、周围神经与肌肉疾病、小儿脑血管疾病、小儿神经系统免疫性疾病、中枢神经系统感染、神经行为障碍性疾病等方面积累了丰富的诊疗经验。在小儿神经系统疑难复杂疾病的诊治方面，处于国内领先地位。
第九名：首都医科大学附属北京同仁医院-儿科
首都医科大学附属北京同仁医院的儿科病房设置血液肿瘤组、RB中心、新生儿组、常见病组，门诊设置儿童保健组、聋儿语言康复训练组、脑潜能开发组、心理咨询组。儿科优势学科为小儿血液肿瘤疾病的综合诊疗，尤其儿童恶性实体瘤的化疗、难治性恶性实体瘤的化疗等方面在国内具有一定的声誉，诊疗水平处于国内较为领先水平。
第十名：首都医科大学宣武医院-儿科
首都医科大学宣武医院的儿科是医院的临床科室之一，由儿科门诊、急诊及病房组成。科室诊治小儿内科疾病，同时科室以儿童神经系统疾病为诊治特色，重点进行儿童难治性癫痫的综合治疗，包括药物治疗、对准备接受手术治疗的癫痫患儿进行术前评估、生酮饮食治疗癫痫等；对于严重的儿童抽动障碍、儿童注意力缺陷多动障碍等病症，儿科除药物治疗之外，已经开展了神经生物反馈、经颅磁刺激等项治疗。