南京甲状腺外科医院排名比较靠前的是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院。
南京医科大学第一附属医院普通外科为国家临床重点专科，亚专业划分精细，学术影响力突出。南京鼓楼医院普通外科是国家重点学科，甲乳专科规范开展甲状腺及腔镜甲状腺手术。东南大学附属中大医院普通外科为省级临床重点专科，甲状腺微创术式成熟，切口美观且并发症少。
1.南京医科大学第一附属医院 普通外科
南京医科大学第一附属医院普通外科是国家临床重点专科建设单位、临床医学博士学位授权点及博士后流动站，为英国爱丁堡皇家外科学院培训基地。科室亚专业设置齐全，包含甲状腺专业，开展规范化甲状腺外科手术，实行MDT多学科诊疗模式。获国家科技进步奖等60余项奖励，承担多项国家级课题，参与制定多项全国诊疗指南，学术与临床水平国内领先。
2.南京鼓楼医院 普通外科
南京鼓楼医院普通外科是国家重点学科、首批国家临床重点专科，设甲乳中心，规范开展甲状腺、甲状旁腺手术及腔镜辅助下甲状腺手术。学科为多所高校博硕士学位授予单位，拥有博士后科研工作站，获江苏省科技进步一等奖等多项科研奖励，技术平台完善，甲状腺疾病外科诊疗体系成熟，综合实力位居省内前列。
3.东南大学附属中大医院 普通外科
东南大学附属中大医院普通外科是江苏省临床重点专科，设甲乳相关专业方向，开展甲状腺肿瘤微创术式，具有疗效好、切口美观、并发症少的特点。科室为全国首批硕士学位授予单位，拥有多个省级学会重要任职，获多项国家及省部级科技进步奖，与多国大学医院建立合作关系，微创外科领域在国内及华东地区声誉良好。
4.东部战区总医院 普通外科
东部战区总医院普通外科是国家及江苏省重点学科，设甲乳专业组，融医疗、教学、科研为一体。科室为南京大学博士学位授权学科、博士后流动站，拥有院士领衔的高水平团队，获国家科技进步奖、何梁何利科技进步奖等多项重要奖项，承担多项国家级科研课题，疾病诊疗依托强大的综合外科平台开展。
5.南京市第一医院 甲乳外科
南京市第一医院甲乳外科配备数字化乳腺钼靶、高清晰乳管镜、甲状腺腔镜器械等先进设备，常规开展甲状腺良恶性疾病手术及综合治疗，重点开展改良甲状腺癌根治术。科室致力于乳腺甲状腺疾病临床研究，承担南京市医学科技发展重点项目，在国内外核心期刊发表论文60余篇，甲状腺癌外科诊疗经验丰富。
