中国排名第一的食道肿瘤医院是上海市肺科医院，该医院胸外科在复旦大学医院管理研究所发布的“中国医院最佳专科声誉排行榜”中，近10年均在前三位。食道肿瘤医院好的还有上海市胸科医院、四川大学华西医院的胸外科等，前者是国内最早建立胸外科的单位之一，后者连续六年在复旦排行榜排第4名（综合医院排名第一）。
第一名：上海市肺科医院-胸外科
上海市肺科医院胸外科是国家重点临床专科，上海市重点学科，上海市临床重点专科，至今已实施各类胸外科手术10余万例。擅长食管肿瘤、肺癌等的治疗，目前拥有5个普通病区，1个特需病区及2个监护病房，是世界手术量最大的普胸外科中心，微创手术量国际首位。在复旦大学医院管理研究所发布的“中国医院最佳专科声誉排行榜”中，近10年均在前三位，2018-2019年位列普胸外科第二名，中国医院科技量值评价2018-2019年位列全国第二，2017-2020年全国医院互联网影响力排行胸外科第一名。
第二名：上海市胸科医院
上海胸科医院是国内最早建立胸外科的单位之一，是我国最早成立的一家以治疗胸部疾病为主的专科性医院，培养了全国一大批胸外科人才，是胸外科人才的培养摇篮。2011年获得国家重点专科，下设肺外科、纵隔外科、食管外科、气管外科、肺移植、等亚专科，目前有胸外科医师40人，年手术量近万台，其中胸腔镜微创手术达近90%，达芬奇机器人手术达200余台/年。
第三名：四川大学华西医院-胸外科
四川大学华西医院胸外科是国内最早建立的胸心血管外科专业之一。2011-2016年连续六年在全国医院专科声誉复旦排行榜第4名（综合医院排名第一），2017年医院科技影响力全国排名第三名。科室在国内率先开展局部晚期肺癌的外科治疗，居国内领先水平并达到国际先进水平；创立了食管癌的食管分层吻合技术，极大降低了吻合口瘘发生率，达到国际领先水平；胸内食管胃半机械吻合术也具国际先进水平。
第四名：广州医科大学附属第一医院-胸外科
广州医科大学附属第一医院胸外科是首批国家临床重点专科、国家呼吸疾病临床医学中心肺癌学术带头团队、呼吸疾病国家重点实验室肺癌学术带头团队、广东省重点学科。科室何建行教授及其团队在早期肺癌的筛查及诊断（早期肺癌治愈率几乎达到80%）、肺移植技术和快速康复日间手术理念，更是将部分胸外科手术革命性进化为日间手术，即24小时内（出、入院）等方面成果显著，使患者获得了更好的生存获益和极佳的生活质量，在食道肿瘤方面也有丰富的经验。
第五名：复旦大学附属中山医院-胸外科
复旦大学附属中山医院胸外科，目前已经发展成为集“医、教、研”一体的胸外科疾病诊疗中心，2011年被评为卫生部临床重点学科。科室共拥有床位115张，年手术量4000余台，其中肺癌手术2500余例，食管癌手术600余例。目前科室能开展各类常规胸外科手术，其中也包括肺癌隆突成型，肺上沟瘤切除，双袖式肺叶切除、气管肿瘤、肺减容、结肠代食管、胸壁巨大肿瘤切除胸壁重建以及脓胸开窗引流联合肌瓣转移胸壁重建等高难度胸外科手术。
