新疆儿童青少年心理医院排名比较靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学附属肿瘤医院。
新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科是国家级精神科规培基地及自治区心身医学质控中心，在儿童期情绪行为障碍及亲子教育问题的综合干预上拥有权威专家。新疆医科大学第一附属医院心理医学科是全疆综合医院中亚专业最齐全的科室，独立设置儿童与青少年精神病学亚专业且诊治水平保持疆内领先。新疆医科大学附属肿瘤医院临床心理科在子女教育问题、考试紧张及学习困难等青少年心理调治上具备显著优势。
1.新疆维吾尔自治区人民医院 临床心理科
新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科是国家级精神科住院医师规范化培训基地及自治区级精神科临床重点学科。学科带头人邹韶红主任医师为医学博士、博士生导师，兼任中华医学会精神科学会委员、新疆医学会心身医学专业委员会主任委员。
科室将儿童期的情绪障碍和行为障碍纳入核心诊治范围，针对亲子教育、考试焦虑、学习困难、社会适应等提供心理咨询与治疗。科室设有沙盘治疗室，承担多项国家自然科学基金项目，在国家级核心期刊发表论文200余篇。
2.新疆医科大学第一附属医院 心理医学科
新疆医科大学第一附属医院心理医学科是全疆综合医院中亚专业设置最为齐全、专业技术力量最强的科室。科室的亚专业明确包含儿童与青少年精神病学，与北京大学、中南大学、四川大学的精神卫生研究机构建立了长期稳定的战略合作关系。诊疗范围涵盖儿童和青少年精神障碍等近四百种精神障碍和心理问题的诊断治疗。新疆医科大学精神病与精神卫生学教研室及硕士学位点均设置于此，承担多项国家和自治区级科研课题，学术水平全疆首屈一指。
3.新疆医科大学附属肿瘤医院 临床心理科
新疆医科大学附属肿瘤医院临床心理科熟悉临床心理科常见病、多发病、疑难病的诊治，在处理子女教育问题、考试紧张、学习困难、人际交往障碍及各种情绪问题等方面具有显著优势。针对儿童青少年成长过程中面临的各类心理困境，科室通过系统化干预手段开展综合调治，展现出扎实的临床功底，为患者提供专业的心理健康服务。
4.新疆医科大学第二附属医院 临床心理科
新疆医科大学第二附属医院临床心理科实行去掉传统铁门铁窗的开放式住院治疗，人性化得到充分体现。重点发展急重症、疑难复杂精神卫生疾病现代诊断技术，明确将青少年心理问题、学习障碍问题纳入诊疗范围。科室坚持标准化诊断、规范化治疗的目标，充分发挥临床和心理结合的优势，在全省三级甲等综合性医院中医疗质量名列前茅。
5.石河子大学医学院第一附属医院 康复心理科
石河子大学医学院第一附属医院康复心理科是兵团心身医学医疗质量控制中心及中华医学会心身医学分会高级心身医学中心单位。学科带头人张桂青主任医师为国务院特殊津贴专家、博士研究生导师，兼任中国康复医学会康复心理专业委员会副主任委员等多项职务。科室常规开展儿童心理与行为障碍、儿童注意缺陷多动障碍、抽动障碍的诊断与治疗。护理团队专门开展青少年人际管理团体治疗，已拥有各级科研课题30余项，获省部级科技进步奖7项。
