齐齐哈尔医院的齐齐哈尔医学院附属第一医院好，该院是全国卫生系统先进单位、国家级住院医师规范化培训基地。医院拥有市级医学重点专科12个，获批了中国卒中中心联盟第二批“综合卒中中心”的认证。此外，齐齐哈尔比较好的医院有齐齐哈尔市第一医院、齐齐哈尔医学院附属第三医院，前者是全国第三批、全省首批公立医院综合改革试点单位，后者是全国首批、黑龙江省首家三级甲等医院，医院信息化建设处于省内领先水平。
第一名：齐齐哈尔医学院第一附属医院
齐齐哈尔医学院附属第一医院是全国卫生系统先进单位、全国百姓放心示范医院、国家级住院医师规范化培训基地。医院现拥有5个市级领军人才梯队、12个市级医学重点专科以及齐齐哈尔市脑科研究所、齐齐哈尔医学院甲状腺研究所、齐齐哈尔医学院神经病学研究所。医院通过了国家标准版胸痛中心、中国卒中中心联盟第二批“综合卒中中心”的认证。
第二名：齐齐哈尔市第一医院
齐齐哈尔市第一医院为集医疗、急救、预防、科研、教学、康复等为一体的大型三级甲等综合医疗机构，是黑龙江省西部地区区域医疗中心，是全国第三批、全省首批公立医院综合改革试点单位。先后荣获“全国特色文化医院”“全国文明单位”等荣誉称号。
第三名：齐齐哈尔医学院附属第三医院
齐齐哈尔医学院附属第三医院是集医疗、教学、科研、预防、保健于一体的高水平学术型医院，为全国首批、黑龙江省首家三级甲等医院。医院信息化建设处于省内领先水平，并开展了多项技术，其中有50余项技术填补省内、市内空白。
第四名：齐齐哈尔医学院附属第二医院
齐齐哈尔医学院附属第二医院为一所大型三级甲等综合性医院，是全国文明单位、全国住院医师规范化培训基地。医院诊疗设备先进，技术力量雄厚，优势学科集群发展，特色突出，血液病诊疗已与国际接轨，自体造血干细胞移植技术在黑龙江省西北部地区首开先河，腔镜与介入技术始终处于全市领先地位。
第五名：齐齐哈尔市中医医院
齐齐哈尔中医院是全国示范中医医院暨三级甲等中医医院。具有中医特色的专科19个，每科的专家都小有名气，吸引着四面八方的患者。医院曾荣获过省级文明单位、全国卫生系统先进单位等荣誉称号。
第六名：解放军203医院
解放军203医院是一所容“医疗、教学、科研、保健”为一体的现代化综合性三级甲等医院。开展新技术114项，多项技术省内领先。先后被评为“全国拥政爱民先进单位”、“国家爱心献功臣行动先进单位”、“全军为部队服务先进单位”、“全军抗洪抢险先进单位”。
第七名：齐齐哈尔协育友好医院
齐齐哈尔协育友好医院目前成为以妇幼保健为中心，以儿科、妇产科为重点，内外、骨等各科协调发展的大型综合性医院，为黑龙江省首家三级甲等妇幼保健院。 拥有数字化脑电图仪、腹腔镜、数字胃肠机等先进设备，可为疾病的诊治提供保障。
第八名：齐齐哈尔建华医院
齐齐哈尔建华医院是集医疗、教学、科研、康复、预防、社区卫生服务于一体的国际三级甲等医院，是黑龙江省新农村合作医疗定点医院、爱婴医院。设有烧伤科、腰间盘科、乳腺科、眼科等科室。医院专家队伍、技术力量、医疗设备、医疗规模、服务环境在市独树一帜。
第九名：中国人民解放军联勤保障部队第九六一医院
中国人民解放军联勤保障部队第九六一医院是一所集医疗、预防、保健、科研、教学为一体的现代化综合三级甲等医院。医院整体技术水平在黑龙江省西部地区、内蒙古东北部地区占有较明显优势。先后被评为全国拥政爱民先进单位、医疗扶贫先进单位。
第十名：齐齐哈尔市第一医院分院
齐齐哈尔市第一医院分院现已成为一所以心血管内科、神经消化内科、妇产科、综合外科、骨科引领，集医疗、科研、预防为一体的三级医院。拥有美国GE螺旋CT、彩超、经颅多普勒、酶标仪、生化分析仪、进口血细胞分析仪、无创同步呼吸机、多功能心脏监护仪、心脏除颤器等大型医疗设备60余台件。总院派驻优秀专家常年在分院工作，总院专家可随时到分院会诊、手术，并免费出车相互转诊，实现了总院与分院的资源共享。