江苏省儿童医院比较好的有南京市儿童医院、苏州大学附属儿童医院、徐州市儿童医院等，南京市儿童医院形成独具特色的专科优势，处于全国先进水平；苏州大学附属儿童医院是江苏省儿科紧急医学救援基地；徐州市儿童医院拥有江苏省临床重点诊疗科室10个，徐州市疾病诊疗中心2个。
第一名：南京市儿童医院
南京市儿童医院是一所集医疗、科研、教学、康复、保健为一体的三级甲等儿童医院，医院专科齐全，涵盖儿童医疗各个领域，是江苏省小儿先天性心脏病诊疗中心、江苏省新生儿疾病诊疗中心、江苏省医疗质量控制中心挂靠单位等，能够开展许多世界前沿的先进诊断、诊疗技术和高难度手术，形成独具特色的专科优势，处于全国先进水平。
第二名：苏州大学附属儿童医院
苏州大学附属儿童医院是一所集医教研防为一体的三甲儿童专科医院、国家儿童区域医疗中心创建单位。医院在艾力彼《医院蓝皮书》2021届中国儿童医院排行榜居第12位。作为江苏省儿科紧急医学救援基地，医院还承担江苏省突发公共卫生事件紧急医学救援任务。
第三名：徐州市儿童医院
徐州市儿童医院作为苏北地区集医教研防为一体的三级甲等儿童医院 ，拥有江苏省临床重点诊疗科室10个，徐州市疾病诊疗中心2个，徐州市医学优势学科1个，徐州市临床重点专科9个。医院是国家级住院医师规范化培训儿科培训基地，获得科研成果奖励130项，授权专利86项。
第四名：南京医科大学第一附属医院-儿科
南京医科大学第一附属医院儿科是“十一五”江苏省重点学科儿科学的重要组成部分，设有新生儿、血液肿瘤、感染（呼吸，消化）、内分泌、心血管、风湿免疫等6个亚专业。其中新生儿科是省厅妇幼重点学科，小儿内分泌、感染专业是国家药物临床试验基地。科研方面也取得了显著成绩，承担着7项国家自然科学基金及省社会发展基金、1项教育部博导类博士点基金项目、3项省厅科研基金及2项省卫生厅重点人才项目。
第五名：南京鼓楼医院-儿科
南京鼓楼医院儿科是南京鼓楼医院的重要组成部分。科室承担着儿科常见病多发病等疾病的临床诊疗工作，其中儿童呼吸、肾脏、风湿免疫、内分泌和新生儿为科室特色。儿科拥有技术精湛的医护人员，设施齐全，技术力量雄厚，为每位患者提供一流的诊疗服务。
第六名：东南大学附属中大医院-儿科
东南大学附属中大医院儿科现为江苏省临床重点专科，江苏省巾帼示范岗，江苏省青年文明号。近年来，承担国家973课题，国家自然基金课题，省、部级及市级自然基金课题和社会发展基金课题多项，部分研究成果分别获教育部、江苏省政府、南京市政府及江苏省医学会成果二等、三等奖，江苏省科技进步引进一等奖。连续四年举办省继续医学教育项目“围产儿热点问题医学论坛”，收到良好效果。
第七名：东部战区总医院-儿科
东部战区总医院儿科现为全军儿童肾脏病创新研究基地与南总儿童肾脏病诊疗中心，是国内最早的儿童肾脏病专科之一，长期致力于小儿肾脏病的临床和科研，多次在国内首先报道发现罕见病例。科研课题与科技成果等方面均处于全国儿科同行的前列近10来获得全军医疗成果二等奖3项、中华中医药学会科学技术奖二等奖1项、中国中西医结合学会科技进步二等奖1项。
第八名：徐州医科大学附属医院-儿科
徐州医科大学附属医院儿科，是江苏省人民政府重点学科、江苏省省级重点临床专科、徐州市卫生健康委员会和徐医附院重点学科、江苏省危急重症新生儿救治中心。近年来获多项国家、省、市课题资助，获徐州市医学新技术引进奖一等奖1项，徐州市人民政府科技进步奖二等奖4项，三等奖5项，累计发表医学论文500余篇。
第九名：南京市第一医院-儿科
南京市第一医院儿科，设有普通门诊、隔离门诊、儿科专家门诊、儿童哮喘专科门诊、儿科急诊、儿科病房、儿科留观病房及儿科输液室，对儿童各个系统常见病及疑难杂症有较高的诊治水平。同时承担着南京医科大学本科生及研究生、留学生的教学；每年发表核心期刊的论文数十篇。承担省级科研多项。