沈阳市中医院擅长针灸科、心内科、治未病中心、老年病科等。这些科室设备齐全、技术力量雄厚，可以为患者提供高水平的治疗。
1、针灸科
沈阳市中医院针灸科是沈阳市针灸专业重点科系，是拥有由国家级著名老中医、国务院政府津贴获得者、市级名老中医获得者的专家队伍，科室在全国首创磁疗罐、磁针器，率先发明使用中风治疗仪、磁缇针，己拥有针灸专业国家专利7项，除此治疗神经系统疾病如头晕、重症肌无力、格林巴利、中风后遗症等疑难杂症。
2、心内科
沈阳市中医院心内科，是由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成。熟悉心内科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗冠心病、心律失常、高血压、高脂血症、心功能不全、心力衰竭、心绞痛、心肌梗死等方面具有显著优势。
3、治未病中心
沈阳市中医院治未病中心，是以老年人常见病，多发病，包括老年心血管疾病、老年神经系统疾病、老年消化系统疾病、老年呼吸系统疾病、老年内分泌系统疾病、老年骨关节系统疾病等多病一体进行临床诊疗，特别是对于老年性便秘、老年衰弱，老年疼痛，眩晕，老年谵妄，老年睡眠障碍等多种综合征进行老年综合评估和干预指导，以及癌症晚期患者和临终患者的终末期照护，将医院的医疗、护理康复、治未病等专业和养老事业相融合。
4、老年病科
沈阳市中医院老年病科，是沈阳市老年病患者防病、保健、治疗的理想选择。科室技术力量雄厚，并在长期的临床实践中，不断总结经验，形成自己一整套的老年病的预防治疗方法，中西医并重，在“西医不滞后”的前提下发展中医药特色，在继承前人中药、针灸、拔罐、穴位贴敷等疗法基础上，“勤求古训，博采众方”结合现代疾病特点及现代医疗诊断技术，老年病防治水平处于市内领先行列。