福建小儿呼吸科比较有名的医院是福建省儿童医院、福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院。
福建省儿童医院小儿呼吸科是省级临床重点专科，为福建医科大学儿科呼吸专业硕博培养点，牵头开展多项特色技术，疑难重症诊疗经验丰富。福建医科大学附属第一医院儿科是省级临床重点专科，为全省儿科医疗教学科研中心之一，教学与科研成果丰硕。福建医科大学附属协和医院儿内科是省内最早的儿科硕博培养基地，多个亚专业达国内先进或省内领先水平，呼吸专科特色鲜明。
1、福建省儿童医院 小儿呼吸科
科室是福建医科大学儿科呼吸专业硕博培养点，2022年获批省级临床重点专科，2023年获“儿童呼吸学科规范化建设项目”优良合格单位。由病房、支气管镜室等多部门组成，是福建省率先开展儿童脱敏免疫集群治疗的科室，开展支气管镜异物钳取、全气道一氧化氮检测等多种先进术式。
建立儿童喘息性疾病队列研究，是儿童哮喘标准化诊疗区域中心，擅长诊治重症肺炎、哮喘持续状态等多种专科疑难疾病，疑难重症收治占比高，学科带头人刘光华教授造诣深厚，上海儿童医学中心张皓主任长期驻院指导。
2、福建医科大学附属第一医院 儿科
科室是集医疗、教学、科研于一体的省级临床重点专科，为全省儿科医疗教学科研中心之一，也是国家综合癫痫中心核心科室、国家级儿科住院医师规范化培训基地、儿科学硕士研究生学位授予点。设有呼吸、神经、消化等多个亚专业及专病门诊，配备齐全专业检查设备，擅长各类儿科疾病诊疗。
先后荣获多项集体荣誉，《儿科学》课程获评多项省级优质课程，承担多项省级以上科研项目，发表论文360余篇，获25项科技成果奖，教学与临床实力稳居省内前列。
3、福建医科大学附属协和医院 儿内科
科室是福建省最早的儿科硕、博士研究生培养基地，国家级儿科医师规范化培养基地、省级临床重点专科，为全省儿科临床、科研和教学中心。儿童呼吸、变态反应专科是特色专业，以儿童哮喘及慢性咳嗽为核心，开展支气管纤维镜、脱敏疗法等技术，建立哮喘标准化门诊及慢病管理体系。
多个亚专业达国内先进或省内领先，承担多项国家及省级课题，获多项科技成果奖，专家团队在各级学术组织担任重要职务，疑难重症救治能力突出。
4、福建省立医院 儿科
科室始建于1938年，在省内儿科界享有盛誉，是多所院校教学基地、硕士研究生培养点、国家级住院医师规范化培训基地，为全省儿科医疗教学科研中心。前辈叶孝礼教授获中华医学会儿科“终身成就奖”，是国内儿科中西医结合领域学术带头人。小儿呼吸专科特色鲜明，学科带头人陈巧彬副教授擅长呼吸道感染、哮喘等疾病诊疗，开展肺功能、过敏原测试等检查及规范化管理，同时擅长儿科疑难危重症救治，承担近20项国家级和省部级课题，获多项省级科技进步奖。
5、厦门大学附属第一医院 儿科
科室成立于1971年，是福建省综合性医院中规模最大、专业最齐全的儿童医疗救治中心，拥有多项国家级、省级荣誉及基地资质，是全省唯一国家呼吸系统诊疗中心福建省分中心。涵盖呼吸、重症等12个亚专科，儿童哮喘专科管理获全国奖项，屋尘螨变应原皮下注射特异性免疫治疗获国际认证。依托多个科研平台，获多项专利及软件著作权，参与制定25项诊疗指南，教学体系完善，培养大量儿科专业人才，综合实力达省内领先、国内先进水平。
