南京妇科内分泌医院排名比较靠前的是江苏省妇幼保健院、南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院。
江苏省妇幼保健院妇科是国家临床重点专科，微创妇科与妇科肿瘤技术国内领先。南京医科大学第一附属医院妇科为国家临床重点专科，内镜技术与肿瘤诊疗水平突出。南京鼓楼医院妇产科历史悠久，产科为国家临床重点专科，产前诊断与生殖医学实力强劲。
1.江苏省妇幼保健院 妇科
江苏省妇幼保健院妇科是首批国家临床重点专科建设单位、卫生部四级妇科内镜手术培训基地，为南京医科大学博硕士学位授予点。科室在妇科恶性肿瘤、子宫内膜异位症、盆底重建、生殖道畸形矫正等领域优势显著，腹腔镜下腹膜外入路淋巴结清扫术达国际领先水平，妇科机器人手术省内领先。
科室承担全省妇科疑难病症指导与会诊，获多项国家自然科学基金课题，科研成果丰硕，是集临床、教学、科研于一体的省内顶尖妇科平台。
2.南京医科大学第一附属医院 妇科
南京医科大学第一附属医院妇科是首批国家临床重点专科建设单位、卫生部四级妇科内镜培训基地，为江苏省临床重点专科，科室在妇科肿瘤规范化诊疗、微创手术领域居国内领先地位，率先开展腹腔镜下宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌等恶性肿瘤根治及分期手术，创新开展腹膜外入路淋巴结清扫术。
科室承担多项国家级、省部级科研课题并多次获奖，负责全省妇科疑难重症的技术指导与会诊工作。
3.南京鼓楼医院 妇产科
南京鼓楼医院妇产科为江苏省临床重点专科，产科为国家临床重点专科。学科带头人胡娅莉教授享有国务院特殊津贴，担任多项国家级、省级重要学术职务，科室获中华医学科技奖、省市科技进步奖多项，承担国家973、国家自然科学基金等课题。
科室对高危妊娠救治、产前诊断、生殖医学、妇科内镜为核心优势，是江苏省产前诊断中心、围产期疾病诊疗中心，综合实力省内顶尖。
4.东南大学附属中大医院 妇产科
东南大学附属中大医院妇产科是江苏省临床重点专科，为博硕士学位授予点，是全国妇科内分泌医师培训基地。科室具备四级妇科内镜手术资质，微创诊疗水平达国际先进，早期妇科恶性肿瘤微创治疗率高，复杂妇科肿瘤、内分泌疾病、盆底重建、高危孕产妇救治等领域优势明显。
承担多项国家级、省部级课题，获多项科技进步奖，与国际多家知名院校保持学术交流，诊疗水平国内先进。
5.东部战区总医院 妇产科
东部战区总医院妇产科为硕士研究生培养学科，连续十余年无孕产妇死亡，高危孕产妇抢救成功率高，科室以子宫内膜异位症、妇科恶性肿瘤、宫腹腔镜微创技术、高危妊娠诊治为特色，开展分娩镇痛、胎儿网络监护、宫颈LEEP术、输卵管介入等先进技术。
科室获江苏省科技进步二等奖等多项成果，发表多篇SCI及核心期刊论文，产科质量与母婴安全保障能力位居省市前列。
