便秘建议就诊于消化内科，上海治疗便秘医院排名靠前的是上海交通大学医学院附属仁济医院消化内科、海军军医大学第一附属医院（长海医院）消化内科、复旦大学附属中山医院消化科等。上海交通大学医学院附属仁济医院消化学科连续多年蝉联中国医院最佳专科声誉排行榜消化病专科榜榜首，是国家临床重点专科，年门诊量稳居全国首位。海军军医大学第一附属医院（长海医院）消化内科是国家消化病临床医学研究中心，消化内镜技术实力突出，多项特色诊疗技术为国内率先开展。复旦大学附属中山医院消化科是卫生部首批临床重点专科，亚专业设置齐全，在门脉高压、慢性肝病等领域诊疗水平国内领先。
1、上海交通大学医学院附属仁济医院 消化内科
该科室是国家（教育部）重点学科、国家临床重点专科，连续多年蝉联中国医院最佳专科声誉排行榜消化病专科榜榜首，年门诊量超70万人次，稳居全国首位，可诊治便秘、慢性胃炎、炎症性肠病、消化道肿瘤、慢性肝病、小肠出血等各类消化系统疾病，内镜中心开展胶囊内镜、ESD、POEM等数十种检查及微创治疗技术，是全国开展内镜诊治项目最为齐全的机构之一，牵头制定多部消化疾病领域临床指南与专家共识。
2、海军军医大学第一附属医院（长海医院） 消化内科
该科室是国家消化病临床医学研究中心、国家重点学科、国家临床重点专科，2023年全国专科声誉排名消化病专科第3名，可诊治便秘、急性胰腺炎、复杂胰胆疾病、早期消化道肿瘤、重症急性胰腺炎等各类消化系疾病，在消化内镜创新转化领域实力突出，国际率先建立4项胰腺癌内镜诊疗新技术，国内率先开展重症胰腺炎多学科救治、胰管结石体外震波碎石等技术，牵头制定50余部消化领域指南共识。
3、复旦大学附属中山医院 消化科
该科室是卫生部首批临床重点专科、内科博士点和博士后流动站，2023年全国专科声誉排名消化病专科第9名，可诊治便秘、门脉高压并发症、慢性肝病、炎症性肠病、急重症胰腺炎、胃食管反流病等多种消化疾病，拥有IBD多学科诊治团队，能开展食管胃静脉曲张内镜治疗、粪菌移植、肝硬度无创检测、ERCP等特色技术，在肝硬化并发症处理、门脉高压诊疗领域处于国内领先水平。
4、上海交通大学医学院附属瑞金医院 消化内科
该科室是国家临床重点专科、国家教育部消化内科重点学科组成单位，2023年获全国专科声誉排名消化病专科提名，可诊治便秘、炎症性肠病、胃肠早癌、胰腺疾病、胃肠功能动力障碍性疾病及各类消化系疑难杂症，能开展复杂ERCP、消化道早癌内镜治疗、胃肠动力检测等技术，炎症性肠病、胰腺肿瘤、复杂ERCP诊疗量名列全市第2位，年接诊大量来自全国各地的疑难疾病患者。
5、复旦大学附属华山医院 消化科
该科室成立于1964年，是国家临床重点专科建设单位、复旦大学消化疾病研究所所长单位，可诊治便秘、消化系肿瘤、各类疑难肝病、消化系统危急重症及疑难病，在消化系肿瘤个体化治疗、疑难肝病诊治、消化内镜介入治疗肿瘤等领域具有特色，技术处于国内领先水平。学科带头人刘杰教授为教育部“长江学者”特聘教授、国家“杰出青年基金”获得者，科室先后承担国家自然科学基金、国家“863”“973”等多项科研项目。
