中国医学科学院血液病医院擅长贫血诊疗科、白血病诊疗科、干细胞移植科、淋巴瘤诊疗科、儿童血液病诊疗科。科室专业技术过硬，填补了医院及国内专业领域多项技术空白。
1、贫血诊疗科
在各种疑难杂症的诊断和治疗上经验丰富，如先天性红系生成异常性贫血（CDA）、Fanconi贫血、先天性角化不良等。擅长各种贫血性疾病的诊治，尤其是重型再生障碍性贫血（SAA）的诊治，疗效一直居国内领先地位，达国际水平。
2、白血病诊疗科
是最早成立的专业组之一，致力于白血病的临床诊疗和研究工作。积极改进白血病的疗效。建立完善了白血病临床研究体系，开展了一系列临床研究。探索出白血病的一系列预后因素，并进行危险度分层治疗，并探索出有效的治疗方案，显著提高了急性白血病的近远期疗效。
3、干细胞移植科
是国内最早开展造血干细胞移植治疗血液病的单位之一，进行了国内第一例自体骨髓移植治疗急性白血病，填补了国内自体移植治疗白血病的空白。在异基因造血干细胞移植、自体造血干细胞移植、半倍体相合造血干细胞移植及血液病等领域取得了令人瞩目的成就。
4、淋巴瘤诊疗科
主要诊治“恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急/慢性淋巴细胞白血病等淋巴系统肿瘤（统称：淋巴瘤）”。临床以精准诊断和基于预后分层的整体治疗为特色，实验室研究方向为淋巴肿瘤的分子发病机制和有效治疗策略，行业内具有较大影响力。
5、儿童血液病诊疗科
是以儿童白血病、儿童骨髓造血衰竭等为研究对象的研究型医疗中心。同时，对少见疑难儿童血液病的诊断、危重儿童血液病的治疗也独具特色，如先天性骨髓衰竭、骨髓增生异常综合征等，疾病诊治水平在国内领先，已全面开展罕见、少见儿童血液病的病因学诊断及造血干细胞移植治疗。
