上海甲状腺癌排名第一名医院是复旦大学附属中山医院，该医院普外科是国家“211工程”建设重点学科、教育部国家重点学科和卫计委国家临床重点专科。上海甲状腺癌好的医院还有上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属华山医院等，前者普外科是上海市重点学科，后者普外科是国家级重点建设学科。
第一名：复旦大学附属中山医院-普外科
复旦大学附属中山医院普外科目前是国家“211工程”建设重点学科、教育部国家重点学科和卫计委国家临床重点专科。普外科现有核定床位198张，年门诊量130000余人次，急诊量12000余人次，年完成大中型手术8000余台。在临床营养、胃肠外科、胆道外科、胰腺外科以及胃肠动力等领域形成研究特色，擅长甲状腺癌、乳腺癌等疾病的诊治。目前，中山医院普外科以亚专业学科建设为主要方向，以多学科协作诊治（MDT）、内镜与微创外科为重要平台。
第二名：上海交通大学医学院附属瑞金医院-普外科
上海交通大学医学院附属瑞金医院普外科是上海市重点学科，学科设有胃肠道癌肿、胆胰疾病、肝门脉疾病、器官移植、微创外科、血管外科、外科重症监护、乳腺和内分泌外科等专业组，形成了以胃肠道癌肿、重症胰腺炎、器官移植、微创外科为特色的，在甲状腺肿瘤、乳腺肿瘤等各个方面具有综合优势的重点学科。
第三名：复旦大学附属华山医院-普外科
复旦大学附属华山医院普外科是国家级重点建设学科（外科学）、国务院首批博士生培养点、国家临床重点专科（普外），是中国抗癌协会肿瘤转移专业委员会依托单位。学科以肝胆、胃肠、甲状腺和乳腺肿瘤等传统优势领域为重点发展方向，代谢与血管外科并重。下设肝胆外科、胃肠外科、甲乳外科、微创代谢疝外科和血管外科等五个专科。专科业务特色包括肝脏移植、胃肠肿瘤早期诊断、微创及多学科综合治疗、甲状腺癌局部复发手术切除等，居国内领先。
第四名：上海交通大学医学院附属仁济医院-普通外科
上海交通大学医学院附属仁济医院普通外科是国内较早成立普通外科学系的医学院校和科室，是国内最早开展门静脉高压症基础与临床研究的单位，目前科室拥有胆胰、门脉高压症、胃肠、肛肠、甲状腺、乳房、腹壁与疝六个专业组。该科室在现代影像学技术在胃肠道肿瘤的应用、分期和评估，胃肠肿瘤规范化综合治疗，以及胃肠道肿瘤的微创手术方面进行了积极探索，每年诊治的胃肠肿瘤病人数量在全市名列前茅，每年完成胃肠肿瘤微创手术200余例，使该科室在这一领域处于全国前列。
第五名：上海交通大学医学院附属第九人民医院-普外科
上海交通大学医学院附属第九人民医院普通外科已经形成了鲜明的专业特色，特别是在甲状腺癌、乳腺癌、肠痿与腹腔感染炎症性肠病(克罗恩病、溃疡性结肠炎)、放射性肠炎、肠梗阻、短肠综合征、肥胖合并睡眠呼吸暂停、症与腹壁缺损、门静脉高压症等方面达到了国内领先水平。
第六名：上海市第六人民医院-普外科
上海第六人民医院普外科由十个专业组成，其中胰腺肿瘤诊治在国内享有声誉，如胰头癌手术联合门静脉血管切除及血管重建，而胃癌治疗在同行中也具有较高的学术地位，目前主要开展的手术有胆囊切除术、阑尾切除术、肝脓肿引流术、结直肠肿瘤切除术、急性重症胰腺炎引流术、胃穿孔修补术等，同时擅长甲状腺肿瘤的手术治疗。
第七名：上海交通大学医学院附属新华医院-普外科
上海交通大学医学院附属新华医院的普外科，学科总体医疗、教学和科研水平居国内领先地位，是一个以消化道肿瘤、器官移植、微创外科为特色，各学科并进发展，医院规模最大的临床科室。普外科是卫生部国家临床重点专科，是卫生部首批批准的肝移植定点医院。以消化道肿瘤根治性手术、多学科综合治疗、规范化治疗和微创外科手术为特色，在甲状腺肿瘤的临床诊治和基础研究方面处于国内外先进地位。
第八名：上海市第一人民医院-普外科
上海市第一人民医院普外科，是国家临床重点专科，国家腹腔镜技术培训基地。普外科是亚洲首家德国癌症协会认证结直肠癌诊治中心上海市器官移植中心、上海市肝脏移植质控中心，进行普外科国际首例血型不相容主动二次肝移植、国内首例四代机器人直肠癌肝转移单孔肠肝同切术等。目前包含6个特色亚学科胃肠外科、肝胆外科、结直肠外科、胰腺外科、甲乳外科、血管外科。各专科特色鲜明，在国内外处于领先水平。
第九名：上海市公共卫生临床中心-普外科
上海市公共卫生临床中心普外科以亚专业学科建设为主要方向，以多学科协作诊治（MDT）、微创外科为重要平台，医疗特色明显，常规开展胃肠道肿瘤、乳腺肿瘤、甲状腺肿瘤、肝胆胰肿瘤等肿瘤的根治性手术（传统手术和微创手术）和综合治疗等。
第十名：上海长征医院-普外科
上海长征医院普外科医教研水平一直位居国内前列，1999年被授予国家重点学科，2001年被授予普通外科学专业国家重点学科，2006年被授予野战外科学专业国家重点学科。在国内较早的开展了腹腔镜巨脾切除、胃、门奇断流术和胰腺手术以及腔镜下颈部无疤痕甲状腺肿瘤手术，目前已经形成了以微创治疗普外疾病为特长、规范治疗消化系统肿瘤为特色的学科。
