温州儿科医院排名靠前的是温州医科大学附属第一医院儿科、温州医科大学附属第二医院儿童内科、温州市人民医院儿科等，温州医科大学附属第一医院儿科是温州市危重新生儿救治中心，位列2019年中国医院科技影响力（儿科）排行榜第74名；温州医科大学附属第二医院儿童内科是兼具儿童全科特色的科室，诊疗范围覆盖儿科各脏器系统常见病多发病；温州市人民医院儿科是首批浙江省卫生厅授予的浙南儿科区域专病中心，列入温州市重点学科发展。
1、温州医科大学附属第一医院 儿科
该科室成立于1957年，是温州市危重新生儿救治中心、国家级儿科住院医师规范化培训基地、温州医科大学硕士学位授予点，获评浙江省巾帼文明岗、浙江省青年文明号，位列2019年中国医院科技影响力（儿科）排行榜第74名。科室现设三个病区，下辖新生儿科、儿童内科、儿童保健科、儿童青少年心理科等亚专科，年门诊量10万余人次，住院患者4000余人次，科室人员12%具有海外留学背景，2人为温州市“新世纪551”人才。近年承担3项国家级自然科学基金、4项省级自然科学基金，发表SCI论文50余篇，可联合多学科开展MDT讨论，为疑难病例提供精准个性化治疗。
2、温州医科大学附属第二医院 儿童内科
该科室2021年成立，兼具儿童全科特色，以“儿童健康优先”为核心理念。2022年起在龙湾院区先后开设儿科急诊、儿科专科门诊，目前专科门诊已覆盖所有专业，诊疗范围覆盖儿科各脏器系统常见病多发病，尤其擅长儿童常见感染性疾病、不明原因发热、重症感染、急性中毒的诊断与管理，同时承担本科生、研究生、规培生及来华留学生的带教工作，开展各层次儿科医师继续教育培训。
3、温州市人民医院 儿科
该科室2018年6月由原温州市儿童医院儿科和温州市人民医院儿科整合成立，是首批浙江省卫生厅授予的浙南儿科区域专病中心、温州市友好型儿童医院建设示范单位、浙江大学医学院附属儿童医院分级诊疗联盟协作单位，列入温州市重点学科发展，获评浙江省五星级青年文明号，拥有中华医学会儿童哮喘标准化门诊。科室设置儿童呼吸、儿童神经、儿童消化、儿童感染、儿童过敏免疫等专业，可开展儿童肺功能检测、呼出气一氧化氮测定、视频脑电图、儿童无痛胃肠镜、儿童纤维支气管镜等数十项特殊检查，能对儿科常见疾病、疑难罕见病进行规范诊断与治疗。门诊开设儿童咳喘、儿童脱敏、儿童抽动等特色亚专病门诊，推出诊前化验、检查导航指引等便民措施。
4、温州第六人民医院 普儿科
该科室下设新生儿科病房、普儿科病房、儿科急诊、儿科门诊，其新生儿科是浙江省新生儿疾病防治中心温州分中心、温州市危重新生儿防治中心，成功救治极早早产儿最小胎龄25+2周、最低体重640g，救治水平达国内先进；可开展呼吸机辅助通气、LISA技术、脐动静脉置管术、亚低温疗法等多项技术，床边振幅整合脑电图、B超、血气分析等多项检查均可实现床边完成。门诊开设生长发育门诊、儿童保健门诊、罕见病门诊、早产儿随访门诊、过敏和免疫门诊、学习困难门诊等多个特色门诊，可满足不同患儿的差异化诊疗需求。
5、瑞安市人民医院 儿科
该科室创建于1978年，是中国生长发育行为医学研究中心分中心、瑞安市危重新生儿救治中心、瑞安市儿童生长发育中心、中国新生儿协作网瑞安分中心，在温州地区乃至省内享有较高声望。科室实际开放病床87张，分普通儿内科病房、新生儿病房、急诊留观病房，年收住病员近6000人次，年门急诊量达35余万人次，可开展儿童支气管镜检查、儿童胃镜检查、新生儿换血疗法、肺表面活性物质替代疗法等多项技术，超早早产儿救治成功率达83.3%，成功救治1例胎龄24+5周、体重仅600克的新生儿，救治水平达国内先进，覆盖儿童常见病、疑难危重症及生长发育相关疾病诊疗。
