福建胸外科比较好的医院是福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院、福建省立医院，福建医科大学附属第一医院胸外科已成为全国一流、省内领先的胸外科疾病诊治中心，在肺癌、食管癌以及其他胸外科疑难疾病诊疗方面居国内领先或先进水平。福建医科大学附属协和医院胸外科是福建省最早成立的普胸外科专业科室和首批重点学科。福建省立医院胸外科也不错，本科的胸腔镜微创技术处于省内先进水平。
第一名：福建医科大学附属第一医院-胸外科
福建医科大学附属第一医院胸外科是该省最早开展胸腔手术和国内首批开展胸腔镜微创手术的老牌单位，现已成为全国一流、省内领先的胸外科疾病诊治中心。在肺癌、食管癌、手汗症、重症肌无力、纵膈肿瘤和其它胸腔疑难疾病诊疗方面居国内领先或先进水平，腔镜微创技术尤具特色和优势，在国内或省内率先开展新技术十余项，多次荣获“福建省科技进步奖”和“福建医学科技奖”。
第二名：福建医科大学附属协和医院-胸外科
福建医科大学附属协和医院胸外科是福建省最早成立的普胸外科专业科室和首批重点学科，为福建省胸心外科学博士点，现为福建省胸心外科研究所、胸心外科福建省高校重点实验室的重要组成单位。协和医院胸外一科现有床位41张，年手术量1700余台，团队在“四分法”支气管吻合技术、“食管悬吊法”清扫喉返神经旁淋巴结、食管癌全程管理及改良快速康复、2.5野食管癌淋巴结清扫等技术居业内一流水平。胸外二科拥有床位41 张，年开展手术约1600台，其中微创手术占90%以上，三、四级手术占比达97%。胸外三科拥有床位12张，是福建省唯一具有肺移植及气管介入亚专科专业特色的胸外科团队，每年完成常规胸外科手术逾500台，包括单孔胸腔镜肺段、肺叶及肺癌根治术、剑突下纵隔肿瘤切除术、胸廓畸形微创治疗等术式。
第三名：福建省立医院-胸外科
福建省立医院胸外科是由该省最早创立的肿瘤科胸组与福建省心血管疾病研究所心外科胸组于2007年1月联合组建而成。该科的胸腔镜微创技术处于省内先进水平，具备独立开展四级胸外科腔镜手术资质并获批为专科培训基地。科室组建以来，已荣获福建省科技进步奖1项、福建省医学科技奖1项，承担省部级科研项目10余项，发表SCI、国家级等论文50余篇，并参与《胸外科疾病诊疗指南》的编写。
第四名：厦门大学附属第一医院-胸外科
厦门大学附属第一医院胸外科是厦门市最早成立的专业普胸外科，现已成为福建省胸外科疾病防治中心之一。分为肺疾病、食管疾病、纵隔疾病、手汗症、胸廓畸形、血气胸、胸部外伤等等亚专业。2016年11月在闽西南地区率先开展肺移植手术，是厦门首例双肺移植手术，也是省首例无体外膜肺氧合辅助下双肺移植手术。2019年6月率先在闽西南地区开展首例达芬奇机器人肺癌切除术，填补了闽西南地区的技术空白。
第五名：福建医科大学附属第二医院-胸心血管外科
福建医科大学附属第二医院胸心血管外科多项技术已达省内领先水平，个别技术已接近国家水平。如巨大肺上钩瘤根治术；食管癌术后气管－胸胃瘘行胸胃切除等高难度手术已达省内或接近国家水平。是泉州乃至福建省较早开展微创治疗手汗症及漏斗胸等手术的科室。
第六名：厦门大学附属中山医院-胸外科
厦门大学附属中山医院胸外科是厦门市重点学科，为“国家住院医师规范化培训基地”，“国家药物临床试验基地”。技术优势及特色诊疗：胸腹腔镜下食管癌三野根治术、胸腔镜下肺癌根治术（肺叶切除、袖式肺叶切除、双袖式肺叶切除、全肺切除）、胸腔镜下解剖性肺段切除术（专针对早期肺癌）、胸腔镜下胸腺切除+前纵膈脂肪清除术等。
第七名：福建省龙岩市第一医院-心胸外科
福建省龙岩市第一医院心胸外科为医院优势科室，在该市率先开展了电视胸腔镜手术，近几年开展了胸腔镜肺叶及纵隔肿瘤切除术、胸腔镜胸膜及肺活检术、胸腔镜下手汗症矫治术，胸腔镜胸膜固定术、胸腔镜肺大泡切除术、胸腔镜及腹腔镜食管癌根治术等微创手术，达到市内领先水平。近年来心胸外科先后获得龙岩市科技进步一等奖一项，二等奖一项，目前已有一项福建省卫生厅青年课题立项，并已开展科研工作。
第八名：福建中医药大学附属人民医院暨福建省人民医院-胸心外科
福建中医药大学附属人民医院暨福建省人民医院胸心外科，是福建省中西医结合研究院食管癌研究所挂靠单位，配置高清胸腔镜、纤维支气管镜以及心电监护仪等高精仪器设备。科室主要开展胸腔镜下肺部肿瘤、食管肿瘤、纵隔肿瘤等手术；纤维支气管镜下气道内肿瘤治疗和气管支架置入等气道介入治疗等。
第九名：联勤保障部队第九一〇医院-胸外科
联勤保障部队第九一〇医院胸外科在肺癌、食管癌及纵隔胸壁肿瘤治疗有丰富经验。能熟练开展食管癌根治术加两野、三野淋巴结清扫、肺癌根治术、袖式肺叶切除术、气管肿瘤切除术、复杂纵隔肿瘤切除术、胸壁畸形矫正、胸壁肿瘤切除加胸壁重建、肺减容术治疗肺气肿等，并在重症胸外伤的抢救及治疗方面经验丰富。微创手术技术是胸外科的优势，已广泛开展了电视胸腔镜微创手术。
第十名：厦门医学院附属第二医院-胸心外科
厦门医学院附属第二医院胸心外科是医院的重点学科，是厦门市呼吸中心(厦门呼吸病医院)的重要组成部分。拥有进口高清胸腔镜手术系统、荧光胸腔镜手术系统、费雪派克呼吸湿化治疗仪等先进医疗设备，开展了多种新技术，如单操作孔胸腔镜手术、胸腔镜下复杂肺段手术、胸腔镜下肋骨骨折固定术等。率先开展冠心病不停跳搭桥手术、双瓣置换手术、I型主动脉夹层主动脉全弓替换+支架象鼻手术等。成立MDT门诊，治疗效果达到国内先讲水平。
