上海市第一人民医院擅长耳鼻喉科、泌尿外科、内分泌科、眼科、检验科。科室专业技术过硬，设备配置先进，治疗水平居国际领先行列。
1、耳鼻喉科
是国家临床重点专科，科室在喉癌、下咽癌和头颈肿瘤的诊断和手术治疗方面全国领先。特别是在保留喉功能的喉癌和下咽癌综合治疗方面具有显著优势。
2、泌尿外科
是中国最早、享有盛誉的学科。目前是国家临床重点专科、上海市医学领先专业重点学科。科室拥有最新一代X达芬奇机器人、3D胺腔镜、融合波铥激光、各类输尿管软硬镜等多种国际先进的设备，是上海规模最大的泌尿专科。
3、内分泌科
为首批16家国家标准化代谢性疾病管理中心之一、全国糖尿病教育管理认证单位。科室在国内率先开展糖化血红蛋白及胰岛细胞抗体检测，还主导成立了上海市第一人民医院甲状腺疾病诊疗中心、骨质疏松联合诊治中心，践行多学科携手诊治内分泌代谢性疾病以及为患者提供一站式服务的诊疗新模式。
4、眼科
是国家临床重点专科，中心的传统强项在于视网膜脱离、糖尿病视网膜病变和老年性黄斑变性等眼底病的临床诊断和治疗。近年来，白内障、青光眼、屈光不正、角膜病、斜弱视等疾病的临床水平也达到国内领先或先进水平。
5、检验科
是一支技术力量强、业务精湛、具有临床和科研竞争力的学科团队。科室现已发展成为了一个检测设备先进齐全、兼具现代化硬件和软件的医学检验科。