治疗肌肉萎缩比较出名的医院是北京积水潭医院、上海市第六人民医院、北京大学第三医院，需就诊于运动医学科，北京积水潭医院运动医学科如今已经发展成为国内首屈一指的运动医学科，其中有些技术属国际首创。上海市第六人民医院骨科-运动医学科为国家级临床重点专科，北京大学第三医院运动医学科是国内最早的综合性运动医学研究所。
第一名：北京积水潭医院-运动医学科
北京积水潭医院运动医学科，如今已经发展成为国内首屈一指的运动医学科。科室在创新的思路引导下，开展了关于肩关节置换、肩袖损伤、肘关节镜、踝关节不稳定、半月板移植、后外复合体重建、髌骨关节不稳定、导航下关节镜手术、肌肉萎缩等多项新技术研究，其中有些技术属国际首创。
第二名：上海市第六人民医院-骨科-运动医学科
上海市第六人民医院骨科-运动医学科，形成了以各种复杂运动伤的治疗，严重关节创伤的微创治疗以及各种创伤及手术后遗症的治疗为主的优势特色专业。涉及肩关节、肘关节、腕关节、髋关节、膝关节、踝关节等全身各大关节，同时擅长肌肉萎缩的治疗。作为上海市第六人民医院优势特色专业，2014年晋级为国家级临床重点专科。
第三名：北京大学第三医院-运动医学科
北京大学第三医院运动医学科（北京大学运动医学研究所）成立于于1959年1月，是国内最早的、唯一的集医疗、教学、科研及下队服务为一体的综合性运动医学研究所。开展的关节镜微创技术已经成为重要的运动伤病诊治手段，肌肉萎缩诊治技术处于国际先进水平。多年来在业内顶级期刊发表高水平学术论文954篇，牵头省部级以上课题130项，总资助金额1亿余元，授权专利126项，累计转化30余项。
第四名：四川大学华西医院-骨科-运动医学中心
四川大学华西医院骨科-运动医学中心龚锦源教授自20世纪60年代起从事运动创伤诊治工作，并于八十年代起开展关节镜手术，是开创国家关节镜外科事业的元勋。科室在国内创新开展肌腱缝合修复半月板损伤、一针一线半月板全内缝合非金属固定、肌肉萎缩相关治疗等。此外膝关节脱位多发韧带损伤急性期缝合修复与重建，膝关节骨折伴软骨缺损的大块异体骨软骨移植修复治疗以及膝关节前、后交叉韧带损伤的重建方面等在国内处于领先水平。
第五名：天津医院-运动损伤关节镜科
天津医院运动损伤关节镜科早在上世纪80年代初期引入关节镜技术，是我国开展关节镜手术最早的医院之一，也是天津市开展关节镜最早和手术例数最多的医院，同时能够专业诊治肌肉萎缩。2000年初天津医院在我国率先成立关节镜科，经验丰富，技术力量雄厚。
第六名：中国人民解放军总医院-骨科
中国人民解放军总医院骨科是国家重点学科、国家重点专科、全军2110工程重点建设学科、全军最大的骨科专科中心、北京市重点实验室，还是全国唯一的骨科与运动康复临床医学研究中心，全军军事训练伤防治研究中心，“中国医院科技影响力(骨科学)”排行榜中排名第一。骨科学科体系分为创伤外科、脊柱外科、关节外科、骨肿瘤科、运动医学科、显微外科、康复与转化医学7个专科及1个骨科研究所，擅长肌肉萎缩的诊断与治疗。
第七名：北京协和医院-骨科
北京协和医院骨科的前身是北京协和医院外科学系骨科专业组，是当时我国唯一的骨科医疗、教学和科研中心。协和骨科现已成为教育部国家重点学科、卫生部临床重点学科、中国医学科学院骨科医学研究中心，连续11年在中国医院专科声誉排行榜位居全国前五名。目前科室已成立脊柱外科中心、关节外科中心、骨科创伤中心3个临床诊疗中心，同时设立运动医学、脊柱微创、骨肿瘤、足踝外科、小儿骨科等十余个亚专业组，可为肌肉萎缩患者提供治疗。
第八名：上海长征医院-骨科
上海长征医院骨科是国家重点学科，国家“211”工程重点学科之一，全军骨科研究所，上海市医学领先专业重点学科，上海市脊柱外科临床医学中心，博士点、博士后流动站，国际内固定研究学会（AO/ASIF）脊柱外科中国培训中心。骨科已发展为融临床、科研、教学为一体，脊柱外科、创伤骨科、修复重建外科和关节外科四个专业学科并行发展的骨外科学科模式，擅长肌肉萎缩的治疗。目前学科医疗和科研环境相对独立，现代化的检测、诊疗设施和手术条件接近世界一流水平。
第九名：四川省骨科医院-膝关节运动医学科
四川省骨科医院膝关节运动医学科是国家中医药管理局重点学科中医骨伤科学建设单位、四川省医学重点学科运动医学科建设单位，四川省重点中医专科建设单位，能够为肌肉萎缩患者提供个性化治疗方案。科室具有处于国内领先水平的关节镜技术，是西南地区率先开展膝关节镜手术的科室之一，亦是西南地区最大的膝关节镜微创外科单体病房。
