全国内分泌科第一名是上海交通大学医学院附属瑞金医院，该医院内分泌科是国家重点建设学科、国内最主要的内分泌代谢研究中心之一。此外，内分泌科排名靠前的医院还有北京协和医院、中国人民解放军总医院。前者的内分泌科室是全国内分泌学科中最完整、最全面的科室；后者的内分泌科是国家新药临床研究中心。
第一名：上海交通大学医学院附属瑞金医院-内分泌科
上海交通大学医学院附属瑞金医院内分泌代谢病专业是国家重点建设学科、国家卫生部内分泌代谢病重点实验室、国家药品和食品监督管理局药品临床试验基地、上海市内分泌代谢病临床质控中心，也是国内最主要的内分泌代谢专业医师进修基地之一。 学科为国内最主要的内分泌代谢研究中心之一，且在许多方面形成自己的特色，与国际先进水平同步发展。
第二名：北京协和医院-内分泌科
北京协和医院内分泌科是国家重点学科。科室始终保持全方位的研究方向，是全国内分泌学科中最完整、最全面的科室。内分泌科研究方向包括垂体疾病、甲状腺疾病、糖尿病、甲状旁腺疾病及骨质病、肾上腺疾病和性腺疾病等。研究涉及流行病学、临床医学和基础医学各个层面，科室学术水平一直处于国内领先地位。
第三名：中国人民解放军总医院-内分泌科
中国人民解放军总医院内分泌科，现有2个专科病房、内分泌科实验室、内分泌专科门诊和糖尿病教育中心。先后被批准为全军内分泌代谢病重点实验室、国家新药临床研究中心。2006年成立了解放军总医院内分泌代谢疾病诊治中心，2008年成为北京重点学科。共获军队科技进步二等奖3项，省部级科技进步奖4项。
第四名：中南大学湘雅二医院-代谢内分泌学科
中南大学湘雅二医院代谢内分泌科为内分泌与代谢病学国家重点学科、国家临床重点建设专科，是糖尿病免疫学教育部重点实验室、国家代谢性疾病临床医学研究中心、代谢性骨病学湖南省重点实验室、院士工作站。该研究所以糖尿病、代谢性骨病、代谢综合征和遗传性内分泌代谢病为主要研究方向，在糖尿病分型诊断与治疗、骨质疏松症早期诊断与治疗方面居国内领先地位，达到国际先进水平。
第五名：中国医科大学附属第一医院-内分泌与代谢病科
中国医科大学附属第一医院内分泌与代谢病科为国家重点学科、省部共建国家重点实验室培育基地、国家临床重点专科建设项目。在复旦大学中国最佳专科声誉排行榜中，连续5年位居全国第七位，东北地区第一位。学科在甲状腺疾病的流行病学和临床诊治方面位居全国的领先地位，创建和完善了一整套甲状腺疾病诊治规范。本学科是我国最早开展糖尿病教育、糖尿病治疗方法临床和基础研究的科室之一。
第六名：山东省立医院-内分泌科
山东省立医院内分泌代谢科是国家临床重点专科、国家临床医学重点学科、山东省医药卫生重点学科、国家中医药管理局中医药科研实验室(三级)、山东省内分泌代谢病临床医学中心、山东省内分泌与脂代谢省级重点实验室，是集医疗、教学、科研、预防保健和指导基层于一体的内分泌代谢病专科。在国际上率先提出“干预脂毒性防治糖尿病”和“早期干预亚临床甲减降低胆固醇减少动脉粥样硬化发生”，建立了内分泌代谢领域重点疾病的中西医结合防治体系。
第七名：四川大学华西医院-内分泌代谢科
四川大学华西医院内分泌代谢科是我国医学院校中最早建立的专业之一，目前已发展成为西部地区一流、在全国内分泌学界有重要影响的医学专科，是四川省重点学科,，国家药品监督管理局四川大学华西医院临床药理基地内分泌专业基地。2011年被国家卫生计生委评为国家临床重点专科项目单位。2018年被四川省卫健委批准为四川省内分泌医疗质控中心。
第八名：上海市第六人民医院-内分泌代谢科
上海市第六人民医院内分泌代谢科，是上海市糖尿病临床医学中心、上海市重中之重代谢病临床医学中心、上海市糖尿病研究所，是国家卫计委重点学科、国家教委重点专科、上海市教委重点学科、上海市医院领先专业重点学科。该学科是国内较早开展糖尿病基础和临床研究的单位，是我国糖尿病分子病因学的发源地之一，亦是我国糖尿病研究领域成果最多、内容最丰富的单位，亦是公认的国内著名、国际知名的糖尿病研究、诊治中心。
第九名：中山大学附属第一医院-内分泌科
中山大学附属第一医院内分泌科是全国较早开展的内分泌科之一，现已经成为国家第一批内分泌专业临床药理基地、国家重点学科。科室在内分泌代谢性疾病等的临床和实验室检查及治疗方面均处于国内先进水平。在国内最早对新诊断2型糖尿病病人进行胰岛素泵强化治疗；是最早开展甲亢动脉栓塞治疗的学科；与泌尿外科紧密合作对各种肾上腺疾病的诊断和治疗处于国内领先地位；在下丘脑—垂体疾病的诊断、以及与脑外科合作对垂体瘤的诊治和随访也处于国内领先水平。
第十名：北京医院-内分泌科
北京医院内分泌科近年来发展迅速、成绩斐然，目前是北京大学医学部、协和医科大学博士学位授予点，在高干医疗保健、医疗、教学和科研等多方面取得了长足的进步，成为在北京和全国具有影响力的重要科室，且在国内较早地开展了内分泌相关激素的临床检测工作。 科室就诊患者的主要病种包括糖尿病及其急慢性并发症、甲状腺疾病、血脂异常、高尿酸血症、痛风等。
