儿童心胸外科比较好的医院是首都医科大学附属北京儿童医院、首都医科大学附属北京安贞医院、复旦大学附属儿科医院，首都医科大学附属北京儿童医院胸外科居国内小儿胸外科领域领先地位，是目前国内专门独立从事儿童普胸外科疾病诊治的专业之一，位居复旦版专科榜小儿胸外科第一位。首都医科大学附属北京安贞医院小儿心脏中心外科是国内第一个以国际先进的内外科紧密结合的工作模式运行的现代化专业儿童心血管病专科。复旦大学附属儿科医院心胸外科对各类先天性心脏病及小儿胸科疾病的治疗积累了丰富的临床经验。
第一名：首都医科大学附属北京儿童医院-胸外科
首都医科大学附属北京儿童医院胸外科是目前国内专门独立从事儿童普胸外科疾病诊治的专业之一，居国内小儿胸外科领域领先地位，位居复旦版专科榜小儿胸外科第一位。胸外科专业特色是漏斗胸微创NUSS手术，特别是复杂胸壁畸形的微创综合诊治；胸部肿瘤、肺部疾病的胸腔镜微创手术技术；纵隔肿瘤、先天性肺疾病的达芬奇机器人手术。
第二名：首都医科大学附属北京安贞医院-小儿心脏中心外科
首都医科大学附属北京安贞医院小儿心脏中心外科是国内第一个以国际先进的内外科紧密结合的工作模式运行的现代化专业儿童心血管病专科，经过三十多年的快速发展，已发展成为医疗设施先进、专业建设完善、技术队伍成熟的儿童心血管病诊疗中心。特色治疗包括左心发育不良NorwoodⅠ期矫治、肺动脉闭锁单源化根治手术、不跨环治疗法乐氏四联症，均取得满意的手术效果，无手术死亡，远期效果良好。
第三名：复旦大学附属儿科医院-心胸外科
复旦大学附属儿科医院心胸外科对各类先天性心脏病及小儿胸科疾病的治疗积累了丰富的临床经验，尤其对新生儿、婴幼儿复杂先天性心脏病不断取得了突破性进展，如新生儿、早产儿完全性大动脉转位的动脉调转术，完全性肺静脉异位引流、主动脉弓离断纠治术、心超引导下肺动脉闭锁球囊扩张术；2017年成功施行了沪上首例新生儿左心发育不良综合征手术。
第四名：重庆医科大学附属儿童医院-心胸外科
重庆医科大学附属儿童医院心胸外科通过几代人不懈的努力，心胸外科规模不断扩大，诊疗水平不断提升，达到西部领先、国内先进水平。主要收治各种类型的先天性心脏病，例如室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭、肺动脉狭窄等简单先心病，大动脉转位、肺动脉闭锁、右室双出口、完全性肺静脉异位引流、法乐氏四联症、单心室、儿童心脏瓣膜畸形、先天性心脏病合并气管狭窄、Cantrell五联症等复杂先心病以及儿童心脏肿瘤等。
第五名：广州市妇女儿童医疗中心-胸外科
广州市妇女儿童医疗中心胸外科开展的业务范围有胸壁畸形的矫治（漏斗胸、鸡胸、Poland综合征等）、肺部病变的手术治疗（肺囊性变、肺肿瘤、肺脓肿等）、胸膜腔病变的手术治疗（脓胸、乳糜胸等）、纵隔肿瘤的手术治疗、膈肌病变的手术治疗（膈疝、膈膨升）等，经过近10年的发展，胸外科无论是在病例数量上，还是在疾病谱上，都不断突破，以胸腔镜为代表的微创手术涵盖了胸外科大部分疾病谱的治疗，且治疗效果满意。
第六名：首都儿科研究所附属儿童医院-胸部及肿瘤外科
首都儿科研究所附属儿童医院胸部及肿瘤外科是目前国内专门独立从事儿童普胸部及肿瘤外科疾病诊治的专业之一，居国内小儿胸部及肿瘤外科领域领先地位。胸部及肿瘤外科专业特色包括漏斗胸微创NUSS手术，特别是复杂胸壁畸形的微创综合诊治；胸部肿瘤、肺部疾病的胸腔镜微创手术技术；纵隔肿瘤、先天性肺疾病的达芬奇机器人手术。
第七名：苏州大学附属儿童医院-心胸外科
苏州大学附属儿童医院心胸外科现每年开展婴幼儿先天性心脏病体外循环手术量在150例左右，先天性心脏病病种全，有室间隔缺损(VSD)、房间隔缺损（ASD）、动脉导管未闭（PDA）、法洛四联症（TOF）等，还积累了大量的体外循环，超滤和改良超滤技术的相关知识和应用体会。并常年开展相关的基础和临床研究，如体外循环和体液免疫、细胞免疫、心酶谱、心钠素内皮素变化、血液循环的变化、肺缺血再灌注等各方面研究。