杭州肺科比较好的医院是浙江大学医学院附属第一医院、浙江大学医学院附属第二医院、浙江大学医学院附属邵逸夫医院，浙江大学医学院附属第一医院的呼吸内科是浙江省创建最早的呼吸内科专科病房，国家临床重点专科，浙江省呼吸系统疾病临床研究中心、首批呼吸与危重症医学（PCCM）规范化建设优秀单位。浙江大学医学院附属第二医院呼吸内科是首批国家临床重点专科建设单位。浙江大学医学院附属邵逸夫医院呼吸内科是第一批委省共建国家呼吸区域医疗中心。
第一名：浙江大学医学院附属第一医院-呼吸内科
浙江大学医学院附属第一医院呼吸内科（呼吸与危重症医学科）是浙江省创建最早的呼吸内科专科病房，国家临床重点专科，浙江省呼吸系统疾病临床研究中心、首批呼吸与危重症医学（PCCM）规范化建设优秀单位、浙江省最大的呼吸系统疾病专科医生培训基地及浙江省呼吸内科领域的带头学科。
第二名：浙江大学医学院附属第二医院-呼吸内科
浙江大学医学院附属第二医院呼吸内科是首批国家临床重点专科建设单位、浙江省医学重点学科，是浙江省呼吸疾病科研、教学、诊断与治疗中心之一。科室设有专科病房、呼吸重症监护室、睡眠监测室、肺功能室、气管镜检查室和呼吸临床实验研究室。学科的重点研究领域是哮喘和慢性阻塞性肺疾病的分子机制、气道黏液高分泌、慢性气道疾病干预策略等方面。
第三名：浙江大学医学院附属邵逸夫医院-呼吸内科
浙江大学医学院附属邵逸夫医院呼吸内科是第一批委省共建国家呼吸区域医疗中心、第一批国家临床研究中心核心单位，第一批国家呼吸药理临床研究机构，国家首批PCCM和呼吸内镜医师培训基地，浙江省医学会呼吸分会主任委员单位。科室具备国际领先的各种呼吸介入诊治及培训硬件设备，是省内最早开展气道内介入诊断和治疗的单位之一，能开展各项介入诊治技术。
第四名：浙江医院-呼吸内科
浙江医院中的呼吸内科，数十年来在慢性阻塞性肺病患者治疗经验的基础上，添置美国RESPIRONICSBiPAP及20余台CPAP呼吸机，用于中、重度OSAS的治疗，在省内居于领先。近5年呼吸科承担省部级科研课题10余项，发表论文近50篇，多次承办国家级继续教育学习班。
第五名：浙江省人民医院-呼吸科
浙江省人民医院呼吸内科是目前浙江省规模最大的集医疗、科研、教学导等于一体的大型综合性三级甲等医院之一，隶属于浙江省卫生和计划生育委员会，现为杭州医学院附属医院。医院设备先进，是浙江省最早建立呼吸重症监护室的单位之一，在无创或有创机械通气治疗的慢性阻塞性肺疾病急慢性呼吸衰竭方面处于省内领先水平，并和医院介入科联合在美国氩氦刀冷冻消融治疗晚期肺癌、支气管动脉栓塞术救治大咯血等方面在省内处于领先地位。
第六名：杭州师范大学附属医院-呼吸内科
杭州师范大学附属医院呼吸内科为医院重点学科。病房规模、技术力量、诊疗水平目前在省内处于较高地位。科室目前承担多项国家级，省市级科研基金项目。每年都有多篇论文在SCI及国家级学术期刊发表。获得国家发明专利2项。参编著作2部。学科带头人及多名高职称专家分别在国家级，省级，市级医学学术机构任职。
第七名：浙江省立同德医院-呼吸内科
浙江省立同德医院呼吸内科已经发展成为集医疗、保健、教学、科研为一体的呼吸病学诊疗中心。科室拥有一流的肺脏介入病学医疗设备、大型肺功能仪、无创呼吸机和睡眠呼吸监测设备等，擅长中西医结合诊治呼吸系统常见病如肺炎、支气管哮喘、支气管扩张症和慢性阻塞性肺疾病（COPD）等，均取得显著疗效
第八名：杭州市红十字会医院-呼吸内科
杭州市红十字会医院呼吸内科经过四十多年的发展，目前已经成为集医疗、科研、教学为一体的重点学科。目前科室负责承担国家自然科学基金1项，浙江省自然基金2项，厅局级课题20余项，先后获得中华中医药学会科学技术奖、浙江省科技进步奖、浙江省中医药科技奖、杭州市科技进步奖等多个奖项。