新疆中医免疫内科医院排名靠前的是新疆维吾尔自治区中医医院风湿科、乌鲁木齐市中医医院风湿科、新疆维吾尔自治区人民医院中医科等，新疆维吾尔自治区中医医院风湿科是新疆第一家中西医结合系统规范治疗风湿免疫性疾病的风湿病专科，对各类风湿免疫疾病的中西医诊治处于国内先进水平；乌鲁木齐市中医医院风湿科由临床经验丰富的主治医师以上职称医务人员组成，在风湿性关节炎、红斑狼疮等多种风湿免疫疾病诊治上具有显著优势；新疆维吾尔自治区人民医院中医科是全疆综合性医院最具中医特色的科室，设有专门的中医治风湿特色专业方向。
1、新疆维吾尔自治区中医医院 风湿科
该科室创建于1997年，是新疆第一家中西医结合系统规范治疗风湿免疫性疾病的风湿病专科，年收治病人3500余人次，年门诊量超3万人次，病床使用率达150％以上。科室对类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等近30种风湿免疫疾病的中西医诊治处于国内先进水平，拥有“五毒通痹”系列中药等中医特色疗法及免疫抑制剂、关节腔穿刺等西医手段。科研方面承担国家自然科学基金2项等各级项目10项，年均发表论文10余篇，是新疆两个省级风湿病学会主委单位，承担全疆医学人才带教任务。
2、乌鲁木齐市中医医院 风湿科
该科室由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成，诊疗团队均具备中级及以上专业技术资质，临床实操与疾病研判经验充足。科室专注于风湿免疫相关疾病的诊疗工作，熟悉风湿科常见病、多发病、疑难病的诊治规范，尤其在治疗风湿性关节炎、红斑狼疮、硬皮病、多肌炎、血管炎、重叠综合征、强直性脊柱炎、银屑病关节炎等疾病方面具有显著优势，可针对患者病情制定规范化的诊疗方案。
3、新疆维吾尔自治区人民医院 中医科
该科室成立于1995年，是集医疗、教学、科研、预防、康复、保健六位一体的综合性科室，也是全疆综合性医院最具中医特色的科室，2011年获评“全国综合性医院中医示范单位”，年门诊量6万余人次，年住院量2500余人次。科室开设中医治风湿特色专业方向，运用中医中药、针灸、推拿、中药熏蒸等多种特色疗法，针对风湿类风湿疾病形成了成熟有效的治疗方案，同时通过名中医带徒、援疆专家引进等模式构建完善的人才梯队。
4、新疆医科大学第一附属医院 中医科
该科室始建于1959年，是集医疗、科研、教学于一体的临床一级学科，诊疗水平位于全疆综合医院中医学科的前列。科室以辛效毅主任医师为核心打造专科诊疗团队，形成了以风湿类疾病、心脑血管疾病、内分泌系统疾病等慢性病康复为特色的诊疗方向，建立科室间中西医转诊的特色诊疗模式。科室长期承担新疆医科大学本硕及本科中医学教学任务，近年来承担省部级、厅局级等各级科研项目13项，发表临床及教学论文四十余篇，获自治区优秀论文奖2项。
5、新疆医科大学第二附属医院 中医科
该科室于1959年建科，是全疆综合医院中首批成立的中医科室之一，在全疆享有较高声誉。科室拥有全国名中医李兴培传承工作室1个，包含享受国务院特殊津贴的全国名中医1人，科室以中西医结合诊治为特色，开放床位34张，门诊中医治疗率≥95%，开展针刺、督灸、推拿等数十种中医特色治疗项目，在风湿类疾病、骨关节病等常见病及疑难病症诊疗上形成了鲜明特色。
