东莞市生殖科比较好的医院是东莞市人民医院、东莞市松山湖中心医院、东莞市妇幼保健院，东莞市人民医院生殖医学科，是东莞市最早成立的公立医院生殖医学科，辅助生殖成功率达到国内先进水平。东莞市松山湖中心医院生殖医学中心临床妊娠率稳居东莞市前列；东莞市妇幼保健院生殖中心承担全市生殖健康技术继续教育任务。
第一名：东莞市人民医院-生殖医学科
东莞市人民医院生殖医学科，是东莞市最早成立的公立医院生殖医学科，先后获得宫腔内夫精人工授精、体外受精-胚胎移植技术及其衍生技术（试管婴儿）资质等人类辅助生殖核心技术。生殖医学科主要针对不孕不育进行治疗，科室人工授精技术和试管婴儿技术水平处于市内领先，省内、国内先进水平，辅助生殖成功率达到国内先进水平。
第二名：东莞市松山湖中心医院-生殖医学中心
东莞市松山湖中心医院生殖医学中心，是东莞地区较早获国家卫生部批准开展人类辅助生殖技术的中心，同时也是南方医院生殖联盟定点单位，中心临床妊娠率稳居东莞市前列，高于全国平均水平。生殖医学中心以不孕不育诊治为服务主体，在女性不孕症、男性不育症等方面建立了一套科学、先进的辅助生殖技术基础研究与治疗体系，于2017年成功完成“东莞市首例-双冻试管婴儿（卵子和胚胎冷冻）”并获得妊娠，填补了东莞地区空白。
第三名：东莞市妇幼保健院-生殖中心
东莞市妇幼保健院生殖中心，是广东省妇幼保健协会生殖保健分会常委单位和东莞市生殖医学分会主委单位，同时承担全市生殖健康技术继续教育任务。科室拥有先进的相关设备，在诊治高龄女性、卵巢功能减退、多囊卵巢综合征、反复IVF失败、反复着床失败、复发性流产等疑难病症及男性不育，具有丰富的临床经验，年均诊疗患者6万多人次且处于高满意水平。
第四名：东莞市滨海湾中心医院-生殖医学科
东莞市滨海湾中心医院生殖医学科，科室拥有先进诊治技术及仪器设备，人员均经中山大学附属第一医院、中山大学附属第六医院进修或学习，积极参加各种专业学术交流，更新专业知识，掌握大量的不孕不育资讯，期间曾发表学术论文多篇，多次获得东莞市科技进步奖。同时医院与中山大学附属第六医院共建生殖助孕医联体，定期指派教授级别的专家到生殖医学科进行坐诊和网上远程会诊服务，为广大不孕症患者提供绿色通道。
第五名：东莞市厚街医院-妇科
东莞市厚街医院妇科设有专家门诊、盆底功能筛查室、盆底功能康复治疗室、微波治疗室、阴道镜室、LEEP刀治疗室、臭氧治疗室、宫腔镜检查室、人工流产手术室、术后恢复室等综合治疗单元，在生殖医学方面经验丰富，近年在东莞市科研机构立项的科研课题有15项，获市科技成果奖3项。发表在国家、省、市级以上刊物的学术论文100余篇。获省市级优秀论文奖10余项。
第六名：东莞东华医院-生殖医学中心
东莞东华医院生殖医学中心，获得国家人类辅助生殖技术准入。科室诊治的范围包括因性功能障碍、性交障碍、排卵功能障碍（如多囊性卵巢综合征）；输卵管性不孕（如输卵管一侧或双侧堵塞、积水）、子宫内膜异位症、男方少弱畸精症、梗阻性无精症、免疫性不孕症、原因不明的不孕症、黄体功能不全或其他原因（如封闭抗体异常）导致的复发性流产等因素导致的不孕症等。
第七名：广东医科大学附属东莞第一医院-妇科
广东医科大学附属东莞第一医院妇科，科室技术力量雄厚，设施齐全，科室拥有Storz高清宫腔镜系统、IBS宫内刨消系统、Stryker高清腹腔镜系统，Erbe电外科工作站、超声刀等进口设备，此外还配备有PK刀、LEEP刀心电监护仪、臭氧治疗仪、气压治疗仪等设备。立博士专家诊室、宫颈疾病专家诊室、内分泌及不孕不育诊室、计划生育门诊、盆底治疗诊室、门诊手术室。
第八名：东莞市第八人民医院-妇产科
东莞市第八人民医院妇产科专业技术水平得到全国专家的肯定。先进的设备，技术力量的雄厚使妇产科成为医院的重点学科品牌专业。服务开展如下：不孕症治疗，分娩前后的检查及诊断，产妇及婴儿的护理。为孕产妇提供全套完善的门诊与住院服务。
第九名：东莞市塘厦人民医院-妇产科
东莞市塘厦人民医院妇产科，由门诊部和住院部两部分组成。妇产科门诊分为妇科和产科区，妇科拥有德国莱卡公司生产的阴道镜、LEEP刀、激光治疗仪等，可开展生殖相关方面的治疗。产科拥有胎心多普勒检查仪、胎心监护仪、心电监护仪等。
第十名：东莞广济医院-妇科
东莞广济医院妇科能够开展普通妇科炎性疾病，计划生育、妇科内分泌、妇科肿瘤、妇科微创和宫颈疾病，主要治疗子宫肌瘤、卵巢肿瘤、宫颈病变、子宫内膜异位症、子宫异常出血、宫外孕、闭经、不孕、不育、盆腔炎症、阴道炎、性传播疾病，更年期综合症等妇科疾病。