治疗卵巢囊肿建议就诊于妇科，北京市治疗卵巢囊肿排名靠前的医院分别为北京协和医院妇科、北京大学第三医院妇科、北京大学人民医院妇科，其中北京协和医院妇科作为国家级重点学科和疑难重症诊治中心，依托众多顶尖平台，诊疗与科研水平引领全国，底蕴深厚；北京大学第三医院妇科在辅助生育、生殖内分泌等领域成效突出，斩获多项省部级以上荣誉，综合实力稳居国内前列；北京大学人民医院妇科是教育部重点学科，在妇科肿瘤、盆底疾病诊治方面达国际先进水平，学术影响力广泛。
1、北京协和医院 妇科
科室隶属于妇产科分组，是国家卫生部命名的林巧稚妇产科研究中心、国家级重点学科、全国妇产科疑难重症诊治中心，拥有多个国家级科研、教学、药物研究基地及世界卫生组织合作中心。涵盖妇科肿瘤、生殖内分泌等多个专业组，各领域均有独到建树，诊疗技术达国际先进，牵头多项全国多中心临床研究，承担大量国家级课题与继续教育任务，培养大批行业骨干，始终引领国内妇科诊疗规范发展。
2、北京大学第三医院 妇科
科室是集临床、教学、科研于一体的综合学科，为博士点、国家教委及211工程重点学科。在辅助生育、妇科生殖内分泌、妇科恶性肿瘤、高危妊娠管理等领域达国内乃至国际先进水平，依托老一代专家积淀，学科实力雄厚。培养数十名博士研究生，斩获多项国家、部委及北京市科技进步奖，发表数百篇国内外学术论文，在行业内占据重要地位，为妇科疾病诊疗提供优质服务。
3、北京大学人民医院 妇科
科室是教育部重点学科、国家卫计委临床重点专科，以妇科肿瘤、盆底疾病、妇科内分泌、微创手术为核心发展方向，成立妇科肿瘤、盆底疾病两大诊疗中心。在卵巢癌、宫颈癌等恶性肿瘤综合治疗，盆底功能障碍性疾病多学科诊疗方面达国际先进水平，承担包括国家863、973在内的180余项课题，斩获国家科技成果二等奖等多项荣誉，人才培养与科研转化成效显著。
4、首都医科大学北京妇产医院 妇科
科室是医院支柱科室，为卫生部临床重点建设专科，在各类妇科良恶性疾病诊治方面经验丰富、技术精湛。率先成立亚洲首个欧洲认证的国际跨学科子宫内膜异位症中心，以及北京市盆底功能障碍性疾病诊治与培训中心，微创诊疗、复杂生殖道畸形矫治等领域居国内领先。承担多项国家级、省部级科研课题，斩获全国妇幼健康科学技术奖等荣誉，举办多个品牌国家级继续教育项目，辐射全国。
5、中国人民解放军总医院 妇产科医学部
科室涵盖妇科、产科、生殖医学科3个亚专科，高职专家阵容强大，综合实力雄厚。妇科在机器人及微创技术治疗良恶性肿瘤、子宫内膜异位症、盆底功能障碍性疾病等方面居国内领先，产科在危重孕产妇救治领域特色鲜明。斩获国家科技进步二等奖2项及多项军队、省部级奖项，生殖医学科开展各类辅助生殖技术，是博士学位授予点及博士后流动站，承担30余项国家级、省部级科研基金，成果丰硕。
