南昌小儿神经内科医院排名靠前的是江西省儿童医院内分泌遗传代谢科、南昌大学第一附属医院儿科、南昌大学第二附属医院儿内科等，江西省儿童医院内分泌遗传代谢科是江西省医学领先学科，为江西省儿童遗传代谢疾病临床医学研究中心，可对遗传代谢相关神经损害开展筛查与多学科管理；南昌大学第一附属医院儿科是江西省成立最早的一批儿科专科，亚专业包含小儿神经方向，拥有完善的科研平台与危重儿童救治体系；南昌大学第二附属医院儿内科设立小儿癫痫门诊，擅长各类儿童神经系统疾病的早期诊断与长期规范化管理。
1、江西省儿童医院内分泌遗传代谢科
该科室1985年设立小儿内分泌专业，2012年更名，为江西省医学领先学科、省内唯一国家级小儿内分泌专业药物临床试验基地，设立四大亚专业，专科年门诊量最高达到21.15万人次，立项课题90余项，斩获多项省级科技进步奖项。科室可对遗传代谢类疾病合并神经系统受累患儿开展综合诊疗，借助基因检测、遗传学分析手段排查代谢因素诱发的发育迟缓、抽搐等神经相关症状，针对小胖威利综合征、染色体病等合并神经发育异常的患儿实施多学科联合管理。科室依托遗传代谢病筛查技术，实现相关神经损伤问题早期识别，同步开展长期随访干预，减少疾病带来的神经功能损害。
2、南昌大学第一附属医院 儿科
该科室拥有80余年发展历史，是江西省较早成立的儿科专科，亚专业方向涵盖小儿神经，年出院病人超过5000人次，年门诊量超过6万人次，同时为儿童“先心病”和“白血病”两病免费救治定点单位。科室搭建区域性危重儿童转运网络，具备完备的危重症救治体系，可对小儿癫痫、脑炎、神经发育异常等小儿神经常见病、疑难重症开展救治。科室配套电生理、分子生物学等多个实验室平台，承担国家自然科学基金等多项科研项目，依托综合医院多学科协作优势，处理小儿神经系统疾病合并感染、血液等合并症，为神经疾病患儿提供一体化诊疗方案。
3、南昌大学第二附属医院 儿内科
该科室1993年迁入现址，多名医师骨干曾赴国内顶尖儿科中心进修，诊疗范围覆盖16岁以下儿童神经系统疾病，开设专门小儿癫痫门诊，配套心电监护仪、呼吸机等诊疗设备。科室擅长儿科疑难杂症诊治，可完成各型儿童癫痫的早期诊断、系统管理，同时开展多动症、抽动症、孤独症等发育行为相关神经疾病评估与干预。科室依托三甲医院一站式检查优势，联动院内神经内科、影像中心开展多学科会诊，对儿童神经系统疑难病症联合评估，兼顾神经疾病治疗与儿童心理行为干预，适合小儿癫痫、发育行为异常等神经类疾病的筛查、诊疗与长期随访。
4、江西省人民医院 儿科
该科室医师团队均为具备丰富临床经验的骨干医师，可对小儿神经系统相关常见病开展基础诊疗干预，处理感染诱发的脑炎、惊厥等小儿神经相关病症。科室依托综合医院多学科资源，能够联动院内神经内科完善神经相关检查，快速识别小儿神经急症，及时开展对症处置。科室规范处理各类儿科感染性疾病，减少感染因素诱发的惊厥、脑损害等神经损伤问题，可对轻症神经疾患开展门诊随访管理，同时兼顾患儿呼吸道、耳鼻喉等合并病症同步治疗，适合小儿神经系统轻症问题的基础诊疗与健康监测。
5、南昌市第一医院 儿科
该科室创立于1934年，是江西省儿科学会常委单位，设有多院区门急诊、普儿病区、新生儿监护病区与儿童保健区，开通24小时危重症救治绿色通道。科室开设儿童健康体检项目，可对儿童发育行为、神经发育情况进行筛查，识别发育迟缓、惊厥倾向等小儿神经相关异常信号，及时转诊或开展基础干预。科室配备完善的监护与抢救设备，能够处置小儿高热惊厥等神经急症，依托儿童保健门诊持续监测儿童神经发育进程，兼顾神经发育筛查与生长发育指导，提供儿童神经相关问题的初步评估、急救处置与健康宣教。
