陕西省中医医院擅长皮肤性病科、肾内科、针灸康复科、脑内科、内分泌科等。上述科室学科综合实力领先，临床专科诊治优势突出，能够为患者提供优质的医疗服务。
1、皮肤性病科
陕西省中医医院皮肤性病科为国家临床重点专科、国家中医药管理局“十二五”重点专科、陕西省中医药管理局重点专科、重点学科、陕西省中西医结合学会皮肤病专业委员会主委单位、陕西省中医皮肤病临床医学研究中心、2015年成立陕西省中医皮肤病研究所。科室自成立以来，继承传统医学疗法、引进现代医学的先进诊疗技术、突出中医药优势，立足于皮肤科常见病、多发病、疑难病的诊疗。
2、肾内科
陕西省中医医院肾内科是国家临床重点专科、国家中医管理局重点建设专科，为省内唯一的“中国中西医结合学会肾脏病专业委员会委员单位”。肾内科设有血液透析室和实验室。拥有先进的诊断技术，特别是肾脏病理诊断技术在西北地区乃至国内具有一定影响。对肾脏疾病的治疗，采用中西医结合方法将“辨病”与“辨证”有机结合起来，既采用规范的西医治疗，同时又积极发挥中医治本的优势，充分体现中医与西医的“优势互补”。
3、针灸康复科
陕西省中医医院针灸康复科是国家重点学科，擅长运用中医康复辨证施治与现代康复辨构论治相融合的诊疗思路，对患者进行个体化评估与治疗。特色技术包括针灸、中药涂擦、中药熏蒸、小针刀、穴位埋线、耳穴、平衡罐等中医康复技术；运动疗法、言语吞咽训练、面部功能训练、新Bobath概念疗法、关节松动术、神经松解术、肌骨筋膜松解术、内脏筋膜松解术、肌肉能量激活术、呼吸导引技术、冲击波疼痛治疗技术等现代康复技术。
4、脑内科
陕西省中医医院脑内科成立于2005年，是集康复临床、教学、科研于一体的现代化康复机构，也是国家中医药重点专科。科室技术力量雄厚，仪器设备齐全，治疗手段丰富，中医特色鲜明。现已形成了中医特色康复治疗与功能重建相结合的学科模式，是西北地区知名的康复治疗中心，是陕西省中医康复专业的教学培训基地和临潼区中医医院等多家医院形成医联体。
5、内分泌科
陕西省中医医院内分泌科是国家中医药管理局“十二·五”重点专科建设单位，陕西省内分泌重点学科及糖尿病专科，是西北五省唯一一个国家中医药管理局批准的区域诊疗中心，“中国住院患者血糖管理培训实践基地”，陕西省中西医结合学会内分泌专业委员会主委单位，陕西省中西医结合学会风湿病副主委单位，陕西中医学院硕士研究生培养点，连续两年被艾力彼管理研究中心评为全国“最佳临床型专科内分泌科”。
