南平三甲医院有福建省南平市第一医院、中国人民解放军联勤保障部队第九〇七医院、福建省南平市人民医院。福建省南平市第一医院拥有5个省级重点专科建设项目，3个省级重点专科，已发展成为“五位一体”的大型医院。中国人民解放军联勤保障部队第九〇七医院以学科门类齐全、技术力量雄厚、特色专科突出等优势在驻地独树一帜，是福建医科大学等11所医学院校教学医院。福建省南平市人民医院配备有种先进的自动化检验仪器，还拥有层流手术室，配有现代化的手术设备和设施。
第一名：福建省南平市第一医院
福建省南平市第一医院已发展成为一所集医疗、科研、教学、预防、保健“五位一体”的大型三级甲等综合医院，现有心血管内科、康复医学科、老年病科等3个省级重点专科，骨科、呼吸内科、医学检验科、麻醉科、医学影像科等5个省级重点专科建设项目。
第二名：中国人民解放军联勤保障部队第九〇七医院
中国人民解放军联勤保障部队第九〇七医院是一所集医疗、教学、科研、康复、保健于一体的综合性三级甲等医院，以学科门类齐全、技术力量雄厚、特色专科突出等优势在驻地独树一帜，是中华慈善总会国际“微笑列车”唇腭裂矫治项目闽北唯一定点医院，南平市慈善总会“光明通道”白内障复明手术定点医院，福建卫生职业技术学院附属武夷医院，福建医科大学、安徽医科大学等11所医学院校教学医院。
第三名：福建省南平市人民医院
福建省南平市人民医院，是一所集医疗、教学、科研、急救、预防、康复和保健于一体的现代化大型综合性三级甲等中医医院。医院拥有国家重点专科1个，省级重点专科2个，省级重点专病2个，省级重点建设专科2个，配备有美国GEC形臂X光机、GE VVE9彩超等各种先进的自动化检验仪器。拥有层流手术室，配有现代化的手术设备和设施，专业设备总值达7389余万元。
第四名：邵武市立医院
邵武市立医院是一所集医疗、教学、科研、保健、康复为一体的三级乙等综合性医院，医院设临床科室25个，医技辅助科室15个，先后获得全国百佳医院、全国卫生系统先进集体、全国百姓放心示范医院、省卫生厅系统学习“白求恩”创“双十佳”活动先进集体，省文明委“创文明行业，建满意窗口”示范单位，第十三省级文明单位等荣誉。