安徽男科医院比较好的有安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院、安徽医科大学第二附属医院等，安徽医科大学第一附属医院泌尿外科是国家临床重点专科建设项目；安徽省立医院泌尿外科是全国首批、安徽首家泌尿外科住院医师规范化培训基地；安徽医科大学第二附属医院泌尿外科为省级和院级临床重点专科。
第一名：安徽医科大学第一附属医院-泌尿外科
安徽医科大学第一附属医院泌尿外科是国家临床重点专科建设项目、安徽省重点学科、安徽省临床重点发展学科，是安徽省泌尿外科学及男科学主委单位。学科已形成以微创泌尿外科、男科早期诊断和治疗等为临床特色的多个发展方向。2016年度复旦大学排行榜专科声誉获提名（全国20），华东区医院专科声誉排行榜排名第六；2017年度中国医院科技影响力排行榜全国第11名，标志着泌尿外科在临床、科研、教学等方面的发展已达到国内较高水平。
第二名：安徽省立医院-泌尿外科
安徽省立医院泌尿外科是全国首批、安徽首家泌尿外科住院医师规范化培训基地，安徽省首批临床特色学科，安徽医科大学、皖南医学院泌尿外科博士、硕士研究生培养点，现为安徽省临床重点培育专科，国家药物临床试验基地。学科共分为5个亚专科方向（肿瘤、结石、肾移植、微创、男科），门诊设有男科学检查治疗室。学科临床经验丰富，对疑难杂症有着独特的见解和治疗方式。
第三名：安徽医科大学第二附属医院-泌尿外科
安徽医科大学第二附属医院泌尿外科为省级和院级临床重点专科，博士、硕士学位授予点，博士后流动站，安徽省器官移植单位。常规开展泌尿外科所有类型手术，分设泌尿系肿瘤、泌尿系结石、神经尿控男科、肾移植四个亚专业，进行高水平的科学研究 ：包括泌尿系统肿瘤、先天性疾病、男科生殖学领域的临床及基础性研究等，注重基础及临床转化。
第四名：合肥市第一人民医院-泌尿外科
合肥市第一人民医院泌尿外科现已发展成为设备齐全、高层次人才集中、手术量较大、业务范围较广的泌尿外科临床、科研和教学中心。在男性性功能障碍、男性不育、性传播性疾病的诊治各方面积累了丰富经验，先后开展男性不育中西医结合综合治疗、性功能障碍的临床治疗、亚临床型精索静脉曲张与男性不育症关系研究等工作。其中开展的显微镜下精索静脉结扎术省内领先。科室在省内影响力不断增强，已成为安徽省男性疾病诊治中心之一。
第五名：合肥市第二人民医院-泌尿外科
合肥市第二人民医院泌尿外科是安徽省“十四五”临床重点专科、合肥市医学重点专科、合肥市男科学临床研究中心，国家住院医师规范化培训基地。开展男性性功能障碍综合治疗：真空负压吸引技术治疗勃起功能障碍、超细精囊镜治疗无精症、阴茎假体植入术、前列腺腔内热疗等。
第六名：阜阳市人民医院-泌尿外科
阜阳市人民医院泌尿外科是市临床重点科室，阜阳市泌尿外科质控中心挂靠科室，阜阳市泌尿外科学会主委单位，阜阳市男科学会主委单位，安徽医科大学硕士研究生培养科室，安徽省男科疾病规范化诊治培训阜阳中心。开展男科诊治工作，目前建立男科工作站，配备了一批先进前前列、性功能治疗仪及自动取精仪等，以进一步提高男科服务能力。常规开展男科常见手术，显微镜下精索内静脉结扎术，精囊镜技术治疗精囊结石及射精管梗阻等。
第七名：合肥市滨湖医院-泌尿外科
合肥市滨湖医院泌尿外科是医院较早成立的专科，为全国较早开展泌尿外科微创手术的科室之一，处于省内先进行列。现已发展成为设备较好、高层次人才集中、手术量较大、业务范围较广的泌尿外科临床、科研和教学中心。目前绝大多数腔内手术该科均能开展，腔道手术已占该科手术总量的70%以上，腔道手术比率、手术量、手术范围、手术效果等均处于省内领先水平，达到国内先进水平，对于男性疾病有着丰富的诊疗经验。
第八名：安徽医科大学附属巢湖医院-泌尿外科
安徽医科大学附属巢湖医院泌尿外科为安徽省临床重点专科，安医大附属巢湖医院临床重点专科，拥有体外冲击波碎石中心、尿动力学检査室、男科诊疗室，长期开展泌尿外科门诊及男性特色门诊。科室设备先进，拥有膀胱尿道镜、前列腺电切镜、精囊镜等先进设备，开展精囊镜、显微精曲等男科手术以及泌尿系统畸形、狭窄等其他泌尿外科手术。