广东治疗甲状腺排名第一名的医院是中山大学附属第一医院，该医院甲状腺乳腺外科为国内较早设立此专科的医院之一，专科学术水平达到国内先进水平，为全国重点学科。此外，南方医科大学南方医院和广州医科大学附属第一医院的普外科也可治疗甲状腺疾病，有着较强的实力。
第一名：中山大学附属第一医院-甲状腺乳腺外科
中山大学附属第一医院甲状腺乳腺外科为国内较早设立此专科的医院之一，专科学术水平达到国内先进水平，为全国重点学科。其中甲状旁腺移植治疗继发性甲状旁腺功能低下症的基础和临床研究水平居国内领先地位，临床治疗水平达世界先进水平。
第二名：南方医科大学南方医院-普外科
南方医科大学南方医院普外科，在华南地区乃至国内外均享有较高的声誉，技术力量雄厚，医疗特色突出，年手术量近两千台次，居南方医院前列。可进行甲状腺疾病、食道反流性疾病、胃及小肠疾病、结直肠疾病、腹部肿块、腹部外伤、各种消化道瘘、急腹症、各种腹壁疝、外科感染、咬蛰伤等疾病的诊治。
第三名：广州医科大学附属第一医院-普外科
广州医科大学附属第一医院普外科，是卫生部内镜诊疗技术（广东）普外科培训基地，设备先进，多项成果先后获广州市、广东省和国家教委等科技进步奖。该科室擅长腹腔镜手术，还开展了腔镜甲状腺腺瘤摘除术和甲状腺次全切除术、腹腔镜结直肠癌根治术等。
第四名：广东省人民医院-血管甲状腺腹壁疝外科
广东省人民医院血管甲状腺腹壁疝外科，诊治大血管和周围血管常见疾病和疑难杂症，临床经验丰富，诊治能力水平位于全国先进水平，可进行主动脉弓部动脉瘤和溃疡、B型主动脉夹层的介入和复合治疗，胸腹主动脉瘤、腹主动脉瘤，采用开放、介入微创和复合手术方法治疗，预防破裂、栓塞等严重并发症发生。
第五名：中山大学附属第三医院-甲状腺乳腺外科
中山大学附属第三医院甲状腺乳腺外科，是临床、教学、科研为一体的综合性医疗专科，为亚洲乳腺癌协作组名誉主席、广东省乳腺病学会主任委员及广东省临床医学学会甲状腺专业主任委员所在科室，2012年被评为卫生部国家临床重点专科。
第六名：中山大学孙逸仙纪念医院-甲状腺外科
中山大学孙逸仙纪念医院甲状腺外科，不论手术量，还是技术水平，都处于广东省领先地位，对甲状腺癌、甲状腺功能亢进、甲状腺腺瘤、结节甲状腺肿、甲状旁腺瘤等的诊治具有丰富的临床经验。甲状腺外科已开展的核心医疗技术：甲状腺及甲状旁腺术中神经监测技术保护喉返神经和喉上神经，甲状腺术中纳米碳技术保护甲状旁腺及其功能，颈和胸部无疤痕的腔镜下经胸乳晕入路、经口腔前庭入路和经腋窝入路的甲状腺切除术等。
第七名：南方医科大学珠江医院-甲状腺外科
南方医科大学珠江医院甲状腺外科，擅长甲状腺、甲状旁腺肿瘤的诊断和治疗，在国内较早开展颈部无疤痕甲状腺切除术，治疗结节性甲状腺肿、甲状腺腺瘤、甲状腺癌、甲状腺机能亢进症、甲状旁腺功能亢进症等疾病。
第八名：深圳市人民医院-乳腺甲状腺外科
深圳市人民医院的乳腺甲状腺外科，是深圳市最早设立，专门诊治乳腺、甲状腺和甲状旁腺疾病的专业化科室。开展了各种乳腺手术，如各类型乳腺癌根治术、乳腺癌保乳手术、前哨淋巴结活检术、乳房重建手术、B超引导下乳腺肿物微创旋切手术；乳腺良性肿瘤选择美容切口或微创切除术、乳腺癌实施根治术或保留乳房根治术及术后一期假体，以及各种甲状腺和甲状旁腺疾病等综合治疗方面积累了丰富的临床经验。
第九名：深圳市第三人民医院-甲乳外科
深圳市第三人民医院的甲乳外科，拥有专科先进的专科诊疗设备，包括3.0核磁共振、乳腺微创旋切系统、消融治疗仪、超声介入电导仪等，为乳腺、甲状腺疾病的治疗提供了充足的保障。科室常规开展乳腺、甲状腺及甲状旁腺疾病的各种手术、淋巴水肿护理、通乳治疗等技术及疑难杂症的多学科联合（MDT）诊治。