上海医院治疗食管癌比较好的是上海市肺科医院、上海市胸科医院、复旦大学附属中山医院，可就诊于胸外科，上海市肺科医院胸外科是国家重点临床专科，并且该科室在2017-2020年，蝉联全国医院互联网影响力排行胸外科第一名。上海胸科医院胸外科是国内最早建立胸外科的单位之一；复旦大学附属中山医院胸外科为卫生部临床重点学科。
第一名：上海市肺科医院-胸外科
上海市肺科医院胸外科是国家重点临床专科，上海市重点学科，上海市临床重点专科，至今已实施食管癌、肺癌等各类手术10余万例，是世界手术量最大的普胸外科中心，微创手术量国际首位。在复旦大学医院管理研究所发布的“中国医院最佳专科声誉排行榜”中，近10年均在前三位，2018-2019年位列普胸外科第二名，中国医院科技量值评价2018-2019年位列全国第二，2017-2020年全国医院互联网影响力排行胸外科第一名。
第二名：上海市胸科医院-胸外科
上海胸科医院胸外科是国内最早建立胸外科的单位之一，是我国最早成立的一家以治疗胸部疾病为主的专科性医院，培养了全国一大批胸外科人才，是胸外科人才的培养摇篮。2011年获得国家重点专科，下设肺外科、纵隔外科、食管外科、气管外科、肺移植等亚专科，在食管癌的治疗方面经验丰富。目前有胸外科医师40人，年手术量近万台，其中胸腔镜微创手术达近90%，达芬奇机器人手术达200余台/年。
第三名：复旦大学附属中山医院-胸外科
复旦大学附属中山医院胸外科，目前已经发展成为集“医、教、研”一体的胸外科疾病诊疗中心，2011年被评为卫生部临床重点学科。目前科室能开展各类常规胸外科手术，其中也包括肺癌隆突成型，肺上沟瘤切除，双袖式肺叶切除、食管癌根治、气管肿瘤、肺减容、结肠代食管、胸壁巨大肿瘤切除胸壁重建以及脓胸开窗引流联合肌瓣转移胸壁重建等高难度胸外科手。常规开展胸腔镜肺叶切除、胸腔镜肺段切除、胸腔镜下食管平滑肌瘤切除、腔镜下裂孔疝修补、纤维支气管镜下支气管胸膜瘘治疗等各类腔镜手术。
第四名：上海交通大学医学院附属瑞金医院-胸外科
上海交通大学附属瑞金医院胸外科是解放后新中国最早建立的胸外科之一，历经半个世纪发展，逐渐成为特色鲜明，技术雄厚的胸外科专科。科室应用胸腔镜技术，完成国内首例胸腔镜下后纵隔肿瘤切除术，使医院在当时胸外科领域处于国内领先地位。科室临床特色鲜明，如全面开展传统胸腔镜及达芬奇机器人手术，对肺、食管、纵隔病变的微创治疗形成特色；是国内最早开展MDT的科室之一，现成立了食管癌、肺癌、肺小结节等多学科诊疗协作组，提高诊疗水平。
第五名：复旦大学附属华山医院-胸心外科
复旦大学附属华山医院胸心外科针对肺癌、食管癌、心脏瓣膜病、冠心病、纵隔肿瘤、重症肌无力等胸心外科疾病进行了大量卓有成效的诊疗工作，安全有效的开展出一系列高难度手术，取得良好的治疗效果，为无数患者解除了病苦，带来了良好的社会效应。
