沈阳甲状腺医院比较好的有中国医科大学附属第一医院、中国医科大学附属盛京医院、北部战区总医院等，其中中国医科大学附属第一医院甲状腺外科在辽宁地区及周边省市享有较高的声誉，同时也是卫计委临床重点专科。此外，甲状腺还可就诊于外科，如中国医科大学附属盛京医院外科为国家临床重点专科建设项目单位。北部战区总医院的普通外科的科室技术力量雄厚。
第一名：中国医科大学附属第一医院-甲状腺外科
中国医科大学附属第一医院甲状腺外科是教育部国家重点学科及卫计委临床重点专科，是目前辽宁省内唯一一家专门从事甲状腺及甲状旁腺外科疾病诊治的专业科室。是该院集医疗、教学、科研为一体的综合性临床专科，在辽宁地区及周边省市享有较高的声誉。在科研方面，科室目前承担包括国家自然科学基金在内的国家及省部级科研课题8项。近5年在各类核心期刊上发表甲状腺专业论文60余篇，其中SCI收录25篇。
第二名：中国医科大学附属盛京医院-外科
中国医科大学附属盛京医院外科为国家临床重点专科建设项目单位。科室现有医护人员320人，下设11个构建完善的普通外科独立专业病房，开放床位479张，年手术量达14000余例。微创技术在普通外科各类手术中的广泛应用是本院普通外科的特色优势，各亚专业均已开展相关的微创手术。目前，在单孔腹腔镜手术、腹腔镜结直肠手术、胰腺癌手术治疗、肝癌手术治疗、甲状腺癌治疗等领域居国内领先水平。
第三名：北部战区总医院-普通外科
北部战区总医院普外科科室技术力量雄厚，开展微创及高新技术，形成以胃肠肿瘤、减重代谢、甲状腺、疝外科为特色的综合性普外科病房。普外科除了专长胃肠胰肿瘤手术，还开展其他各种手术和多种疾病腹腔镜治疗，如腹腔镜胆囊切除、阑尾切除、脾切除、结肠直肠癌手术等。
第四名：辽宁省人民医院-甲状腺乳腺外科
辽宁省人民医院甲状腺乳腺外科可采用创新的三步法三维立体水平式乳腺微创旋切技术，设计了水平式旋切保乳手术的关键步骤、流程以及切缘的判断方法。同时熟悉甲状腺乳腺外科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗甲状腺炎、甲状腺结节、甲状腺囊肿、甲状腺腺瘤、甲状腺肿瘤等方面具有显著优势。
第五名：沈阳市第四人民医院-普外科
沈阳市第四人民医院普外科科室技术力量雄厚，开展微创及高新技术，形成以胃肠肿瘤、减重代谢、甲状腺、疝外科为特色的综合性普外科病房。普外科除了专长胃肠胰肿瘤手术，还开展其他各种手术和多种疾病腹腔镜治疗，如腹腔镜胆囊切除、阑尾切除、脾切除、结肠直肠癌手术等。
第六名：中国医科大学附属第四医院-甲状腺、胆道、减重及代谢外科
中国医科大学附属第四医院甲状腺、胆道、减重及代谢外科，是中国医科大学附属第四医院的集临床、科研、教学为一体的重点学科，是治疗甲状腺疾病、肝胆疾病、病态性肥胖、2型糖尿病的专业诊治中心，专业特色包括甲状腺结节，甲状腺癌，甲亢，甲状旁腺功能亢进症等；2型糖尿病以及肥胖引起的睡眠呼吸暂停综合征等；腹腔镜胆囊切除术、腹腔镜胆总管切开取石术、胆道镜取石术等。
第七名：沈阳医学院附属中心医院-普外科
沈阳医学院附属中心医院普外科是集医疗、科研、教学、预防为一体的沈阳医学院重点科系。设有肝胆外科门诊、专家诊室及病房。学科是医院重点学科之一，开展了三级医院各类复杂手术，并形成了以ERCP技术和经腹腔镜肝胆、胃肠、疝等手术为代表的内镜微创治疗及腹腔镜微创治疗特色，对于各类肿瘤如甲状腺癌、乳癌的规范化治疗也是科室突出的特色。
第八名：沈阳医学院附属第二医院-普外科
沈阳医学院附属第二医院普外科，是以微创为特色的普外肿瘤科，主要治疗胃肠，肝胆胰，甲状腺，乳腺，疝，肛周疾病，阑尾炎等常见疾病，已开展腹腔镜下结直肠癌根治术，消化道穿孔修补术，胆囊切除，胆总管探查T管引流术，巨大肝囊肿切除，肝脓肿引流，腹壁疝修补术，阑尾切除术等，取得了良好的效果。
第九名：辽宁省金秋医院-普外科
辽宁省金秋医院普外科，开展胃、肠道、乳腺、甲状腺肿瘤、腹腔内巨大肿瘤等手术。近年来，开展了自体干细胞移植治疗糖尿病足及下肢动脉硬化闭塞症、腹腔镜手术、恶性肿瘤生物治疗等诊疗技术。诊治范围包括软组织外伤清创缝合、腹部闭合性及开放性外伤、乳腺外伤、肛肠外伤、胃肠道憩室、胆道狭窄或闭锁、先天性巨结肠、乙状结肠冗长症等。
第十名：辽宁中医药大学附属第四医院-普外科
辽宁中医药大学附属第四医院普外科是集普通外科、泌尿外科、胸外科于一体的综合性科室，是服务一流,技术一流的科室，多人曾获得沈阳市优质服务标兵、沈阳市白求恩优质服务标兵荣誉称号。开展十二指肠切除术，是普外科难度极大的手术，手术操作复杂、技术要求较高，该科技术已非常成熟；甲状腺手术具有创伤小、恢复快、住院时间短的优势。